应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何提取转录组中比对上的500多序列及比对参数信息
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
41/1返回列表
查看: 801  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者bright8将赠送您 100 个金币

bright8

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 如何提取转录组中比对上的500多序列及比对参数信息

转录组中测序的unigene序列，与本地建立linux系统建立的数据进行blast比对，如何导出比对后匹配上的转录组序列？有500多条？求大神指点？有没有什么程序或代码，可全部导出。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2020-11-21 09:47:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JY_Lee

新虫 (初入文坛)
blast输出的结果里面有比对上的序列的id和范围的，写个脚本从原来的数据里面提取就可以了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2020-11-21 21:30:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bright8

铁杆木虫 (著名写手)
同问，问题解决了吗？脚本可以分享吗？
赞一下 回复此楼
3楼2021-03-11 11:03:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuannnn

新虫 (正式写手)
偏个楼，请问楼主测序的unigene序列的编号是自己编号的吗？编号有没有什么依据呢？（纯小白，求指教）
赞一下 回复此楼
4楼2021-09-26 16:11:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 bright8 的主题更新
41/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考研] 085602 307分 求调剂 +6 不知道叫什么！ 2026-03-26 6/300 2026-03-27 22:00 by 催化大白
[考研] 一志愿上海理工能源动力（085800）310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 5/250 2026-03-27 18:42 by 小张zxy张
[考研] 286求调剂 +8 PolarBear11 2026-03-26 8/400 2026-03-27 18:05 by yu221
[考研] 340求调剂 +4 jhx777 2026-03-27 4/200 2026-03-27 16:50 by sanrepian
[考研] 269专硕求调剂 +10 金恩贝 2026-03-21 10/500 2026-03-27 15:10 by caszguilin
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-27 3/150 2026-03-27 10:17 by guoweigw
[考研] 333求调剂 +7 87639 2026-03-21 12/600 2026-03-26 22:08 by 不吃魚的貓
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +6 谷雨上岸 2026-03-23 7/350 2026-03-26 18:55 by 不吃魚的貓
[考研] 机械学硕310分，数一英一，一志愿211本科双非找调剂信息 +3 @357 2026-03-25 3/150 2026-03-26 16:34 by by.MENG
[考研] 0856求调剂 +8 zhn03 2026-03-25 9/450 2026-03-26 13:42 by zzll406
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 0703化学求调剂 +6 奶油草莓. 2026-03-22 7/350 2026-03-25 10:00 by shangxh
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭