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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何提取转录组中比对上的500多序列及比对参数信息
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 如何提取转录组中比对上的500多序列及比对参数信息

转录组中测序的unigene序列，与本地建立linux系统建立的数据进行blast比对，如何导出比对后匹配上的转录组序列？有500多条？求大神指点？有没有什么程序或代码，可全部导出。
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1楼 2020-11-21 09:47:34
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JY_Lee

新虫 (初入文坛)
blast输出的结果里面有比对上的序列的id和范围的，写个脚本从原来的数据里面提取就可以了

发自小木虫Android客户端
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2楼2020-11-21 21:30:09
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)
同问，问题解决了吗？脚本可以分享吗？
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3楼2021-03-11 11:03:06
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xuannnn

新虫 (正式写手)
偏个楼，请问楼主测序的unigene序列的编号是自己编号的吗？编号有没有什么依据呢？（纯小白，求指教）
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4楼2021-09-26 16:11:52
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