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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 如何提取转录组中比对上的500多序列及比对参数信息

转录组中测序的unigene序列,与本地建立linux系统建立的数据进行blast比对,如何导出比对后匹配上的转录组序列?有500多条?求大神指点?有没有什么程序或代码,可全部导出。
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JY_Lee

新虫 (初入文坛)

blast输出的结果里面有比对上的序列的id和范围的,写个脚本从原来的数据里面提取就可以了

发自小木虫Android客户端
2楼2020-11-21 21:30:09
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

同问,问题解决了吗?脚本可以分享吗?
3楼2021-03-11 11:03:06
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xuannnn

新虫 (正式写手)

偏个楼,请问楼主测序的unigene序列的编号是自己编号的吗?编号有没有什么依据呢?(纯小白,求指教)
4楼2021-09-26 16:11:52
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