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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于gromacs中的PME
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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】关于gromacs中的PME

在gromacs中我用PME的方法计算静电项，可是只能得到两个group（protein-ligand）之间的coul-SR,没有coul-LR项，改成coulombtype=cutoff就有了coul-LR项，但是不是PME计算长程静电力更准确么？我如何得到用PME方法计算的长程静电力protein-ligand之间的作用呀？
谢谢！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:49 ]
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1楼 2009-07-22 15:02:19
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glai8818

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-27 09:57
不知道你用的是什么版本，应该3.2的不存在这个问题吧，我以前用g_energy看过，应该都有的。后来出来的4.0以后的版本我刚试用，还没有去关注这个问题。
赞一下(11人) 回复此楼
.....
2楼2009-07-25 17:02:47
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