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gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

[交流] 【求助】关于gromacs中的PME

在gromacs中我用PME的方法计算静电项,可是只能得到两个group(protein-ligand)之间的coul-SR,没有coul-LR项,改成coulombtype=cutoff就有了coul-LR项,但是不是PME计算长程静电力更准确么?我如何得到用PME方法计算的长程静电力protein-ligand之间的作用呀?
谢谢!

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:49 ]
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glai8818

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-27 09:57
不知道你用的是什么版本,应该3.2的不存在这个问题吧,我以前用g_energy看过,应该都有的。后来出来的4.0以后的版本我刚试用,还没有去关注这个问题。
.....
2楼2009-07-25 17:02:47
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