24小时热门版块排行榜    

查看: 510  |  回复: 5
当前主题已经存档。

Inorg@USF

木虫 (正式写手)

[交流] 『help』A类错误。。。。

最后检查cif 的时候,有如下a类错误,请高手帮忙建议如何消灭之。。。

Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   2.415
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       2.41      
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.64 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...      10.00 Ratio
PLAT305_ALERT_2_A Isolated Hydrogen Atom (Outside Bond Range ??)          H26     
PLAT353_ALERT_3_A Long    N-H Bond (0.87A)   N4     -   H12    ...       1.26 Ang.
PLAT761_ALERT_1_A CIF Contains no X-H Bonds ......................          ?
PLAT762_ALERT_1_A CIF Contains no X-Y-H or H-Y-H Angles ..........          ?


多谢多谢多多谢!
回复此楼
There is a will,there is a way.
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yy0520yy

金虫 (职业作家)

等高手给你解释一下吧,我只看出来你的CIF文件好像不全啊,好像还得好好精修一下啊!
2楼2009-07-22 07:41:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

244073931

至尊木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
SHFSU01_ALERT_2_A  The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
            Absolute value of the parameter shift to su ratio given   2.415
            Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................       2.41      
没有收敛,需要多修几轮,即可
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...       5.64 Ratio
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent    H     Ueq(max)/Ueq(min) ...      10.00 Ratio
热参数比太大,可用命令isor 0.01使之减小或进行无序处理

其他的是加氢错误(特别是H的方向),删除后重新加氢
3楼2009-07-22 07:50:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

etongtong

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我看:主要问题在加氢
1 INS文件中加入bond $H
2 所有氢建议理论加氢
3 注意收敛。
▄︻┻┳═一................................................
4楼2009-07-22 09:08:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Inorg@USF

木虫 (正式写手)

谢谢大家都帮忙解释。
我的case是,在残峰我找到了所有的H原子。问题是有两个氢原子每轮XL之后,这两个H位置不固定。有没有方法可以固定它们,包括H-N键长在合理范围之内。

多修几轮到收敛,请问如何判断之,是看wR2 和maximum shift/esd么?

多谢!
There is a will,there is a way.
5楼2009-07-22 11:41:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xi2004

至尊木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看样子你的数据没有好到可以修正氢.

如果不是特别必要, 建议理论加氢.

如果是从残余峰找到的氢, 可在xp中用himp的命令使之距离合理,
比如 himp 0.85 h1
然后在.ins文件中还是加AFIX 3 , Ueq用-1.2或-1.5的好.
xi2004-emuch@163.com
6楼2009-07-22 12:02:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Inorg@USF 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +9 archvillain 2026-08-02 11/550 2026-08-02 15:44 by alexon
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 8/400 2026-08-02 15:01 by jHcrHMhbKCFV
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 14/700 2026-08-02 14:58 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 18/900 2026-08-02 14:52 by jHcrHMhbKCFV
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 12/600 2026-08-02 13:43 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +17 低垂的野花 2026-07-31 23/1150 2026-08-02 13:41 by RRRKKK
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 16/800 2026-08-02 13:34 by jHcrHMhbKCFV
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 14/700 2026-08-02 13:34 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 21/1050 2026-08-02 10:56 by iaeyuan
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +8 锦衣卫寒战 2026-07-28 10/500 2026-08-02 10:00 by 锦衣卫寒战
[考博] 2027年申博 50+3 射雕英雄胜 2026-07-30 3/150 2026-08-02 09:36 by lfy8008
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 7/350 2026-08-02 07:59 by 88817753
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +14 wangze12014 2026-07-28 18/900 2026-07-31 18:35 by lzchaihuo
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 11/550 2026-07-29 05:50 by drbart
[基金申请] 同事接到电话了,我却没有 +4 1234567wang 2026-07-27 4/200 2026-07-28 10:11 by GOODLUCKER
[基金申请] 准备明年的基金了 +5 Tide man 2026-07-27 5/250 2026-07-28 09:25 by newfuzzy1
信息提示
请填处理意见