24小时热门版块排行榜    

查看: 1573  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者叶寻将赠送您 5 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

叶寻

捐助贵宾 (初入文坛)

[求助] 小白请教前辈如何确定自己分离的致泻大肠杆菌所属类群?

各位虫友好,我实验室分离了一株致泻大肠杆菌,现在想知道它是什么型。
查阅文献结果:致泻性大肠杆菌( diarrheagenic E. coli, DEC)。肠道致泻性大肠杆菌依其致病机制、临床表现、流行病学特征和血清学分型,可分为5个群:肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic E. coli,EPEC)、肠产毒性大肠杆菌(enterotoxigenic E. coli,ETEC)、肠侵袭性大肠杆菌(enteroinvasive E. coli,EIEC)、肠出血性大肠杆菌(enterohemorrhagic E. coli,EHEC)、肠聚集性大肠杆菌(enterohemorrhagic E. coli,EAEC)。有国内外文献根据大肠杆菌中所含有的毒力基因的情况来进行分型,但是相关文献较少。目前进行了二代测序,发现含有EPEC的ent族基因(肠毒素基因)和EHEC的hlyB(溶血素基因),同时也有16srRNA的进化树结果。
       想请教各位应如何准确定义该菌,是否需要进行血清型测定,或者用示例中的表述方式;例如:ETEC strain SEC470 (F18, LT+, STa+ and STb+),作为一名小白也不清楚这里写的菌株号如何获得。 另外还想请问致泻性大肠杆菌的分型是否有公认的方法?
       感谢各位前辈不吝赐教!!

小白请教前辈如何确定自己分离的致泻大肠杆菌所属类群?
SCI-5种致病型.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

叶寻

捐助贵宾 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biosci at 2020-10-10 08:40:15
不要用16s结果做进化树,要用全基因组序列为出发数据做进化树。

感谢回复,请问能具体介绍一下吗?或者有什么文献可以推荐阅读吗?
非常感谢!
3楼2020-10-13 09:17:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

biosci

捐助贵宾 (知名作家)


不要用16s结果做进化树,要用全基因组序列为出发数据做进化树。

发自小木虫Android客户端
2楼2020-10-10 08:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-02 06:20 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 9/450 2026-11-02 06:13 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 8/400 2026-11-02 06:07 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 9/450 2026-11-02 05:54 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 21/1050 2026-11-02 05:41 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-02 05:34 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:27 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 22:24 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 8/400 2026-11-01 21:35 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 22/1100 2026-11-01 16:35 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 14:48 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 越来越担心硕士毕业后没有竞争力了 +9 zuesli 2026-10-27 15/750 2026-11-01 12:59 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 03:59 by YXM1FDCSE8Bn
信息提示
请填处理意见