24小时热门版块排行榜    

查看: 1371  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者叶寻将赠送您 5 个金币

叶寻

捐助贵宾 (初入文坛)

[求助] 小白请教前辈如何确定自己分离的致泻大肠杆菌所属类群?

各位虫友好,我实验室分离了一株致泻大肠杆菌,现在想知道它是什么型。
查阅文献结果:致泻性大肠杆菌( diarrheagenic E. coli, DEC)。肠道致泻性大肠杆菌依其致病机制、临床表现、流行病学特征和血清学分型,可分为5个群:肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic E. coli,EPEC)、肠产毒性大肠杆菌(enterotoxigenic E. coli,ETEC)、肠侵袭性大肠杆菌(enteroinvasive E. coli,EIEC)、肠出血性大肠杆菌(enterohemorrhagic E. coli,EHEC)、肠聚集性大肠杆菌(enterohemorrhagic E. coli,EAEC)。有国内外文献根据大肠杆菌中所含有的毒力基因的情况来进行分型,但是相关文献较少。目前进行了二代测序,发现含有EPEC的ent族基因(肠毒素基因)和EHEC的hlyB(溶血素基因),同时也有16srRNA的进化树结果。
       想请教各位应如何准确定义该菌,是否需要进行血清型测定,或者用示例中的表述方式;例如:ETEC strain SEC470 (F18, LT+, STa+ and STb+),作为一名小白也不清楚这里写的菌株号如何获得。 另外还想请问致泻性大肠杆菌的分型是否有公认的方法?
       感谢各位前辈不吝赐教!!

小白请教前辈如何确定自己分离的致泻大肠杆菌所属类群?
SCI-5种致病型.png
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

biosci

捐助贵宾 (职业作家)


不要用16s结果做进化树,要用全基因组序列为出发数据做进化树。

发自小木虫Android客户端
2楼2020-10-10 08:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

叶寻

捐助贵宾 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by biosci at 2020-10-10 08:40:15
不要用16s结果做进化树,要用全基因组序列为出发数据做进化树。

感谢回复,请问能具体介绍一下吗?或者有什么文献可以推荐阅读吗?
非常感谢!
3楼2020-10-13 09:17:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 叶寻 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 伙伴们,祝我生日快乐吧 +13 myrtle 2026-03-10 22/1100 2026-03-15 01:12 by 三水双沐
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:14 by JourneyLucky
[考研] 一志愿浙江大学0856材料与化工求调剂 +4 yansheng@211 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:10 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中科院,化学方向,295求调剂 +4 一氧二氮 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:35 by JourneyLucky
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 293求调剂,一志愿陕师大生物学 +3 ??????.?.??? 2026-03-09 3/150 2026-03-11 10:02 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
[考研] 收调剂 +7 调剂的考研学生 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:57 by 麦茶汤圆
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
请填处理意见