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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 请大神帮忙解决如下A类错误
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竺羽心

木虫 (小有名气)

[求助] 请大神帮忙解决如下A类错误 已有1人参与

最近解析晶体时遇到如下错误，不知怎么解决，请论坛里的各位大神帮帮忙！问题如下：
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O10      ..O24      .       2.39 Ang.  
                                                      x,y,z  =      1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O21      ..O11'     .       2.34 Ang.  
                                                1-x,2-y,1-z  =      2_676 Check
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O22      ..O25      .       2.34 Ang.  
                                                1-x,2-y,1-z  =      2_676 Check
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O23      ..O10'     .       2.38 Ang.  
                                                1-x,2-y,2-z  =      2_677 Check
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact  O24      ..O25      .       2.16 Ang.  
                                                      x,y,z  =      1_555 Check

这个结构里有几个游离水分子，椭球都比较大，可能之间存在氢键，请问大家，这类问题要怎么继续精修或者解释
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已然选择了远方，便一路风雨兼程....
1楼 2020-09-22 08:46:51
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SAFEEEE

木虫 (正式写手)
去掉溶剂或者不加H
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2楼2020-09-22 09:28:39
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卡布奇诺7

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

溶剂水的话，如果椭球很大，可能占有率不是1，只有0.5或者更小，调整完占有率后通过AFIX 3将水分子上的氢原子固定，占有率小于1的话，基本上就不会有氢键连接错误了，具有有几个水分子可以参考热重数据.
赞一下(1人) 回复此楼
取次花丛懒回顾，半缘修道半缘君。
3楼2020-09-30 22:07:03
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