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2339773049

新虫 (小有名气)

[求助] pMA5质粒图谱怎么看 已有2人参与

请教一下大家:

1、pMA5质粒的kan基因序列为什么不是以起始密码子开头?

2、该抗性基因上下游的启动子和终止子位于哪里?

3、想p下来这段抗性基因在大肠中表达,会不会因为pMA5是枯草质粒从而表达受影响?

求救急,回答任何一个问题都可以,非常感谢

pMA5质粒图谱怎么看
kan.png


pMA5质粒图谱怎么看-1
kan1.png
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030Selma

金虫 (正式写手)

你可以先把这段序列去NCBI blast一下看是不是完整的

发自小木虫Android客户端
3楼2020-08-22 10:37:03
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2339773049

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 030Selma at 2020-08-22 10:37:03
你可以先把这段序列去NCBI blast一下看是不是完整的

你好  blast显示这段序列是kanR的CDS完整序列 那启动子和终止子是在哪里呢?不太熟悉这方面 求解答 非常感谢
4楼2020-08-22 11:06:16
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030Selma

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by 2339773049 at 2020-08-22 11:06:16
你好  blast显示这段序列是kanR的CDS完整序列 那启动子和终止子是在哪里呢?不太熟悉这方面 求解答 非常感谢...

试试把前后序列都blast一下?具体哪个我也不太清楚,有些启动子和终止子可能多个基因共用的

发自小木虫Android客户端
5楼2020-08-22 15:41:11
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wangyuan0929

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

起始密码子并不一定是AUG,GUG有的时候也是可以作为起始密码子发挥作用的
6楼2020-08-25 11:05:09
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