| 查看: 736 | 回复: 4 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
snowliu2007木虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】关于氢键络合物的求助
|
||
| 如果形成氢键络合物的两个单体可以形成氢键的部位很多，也就是是说这两个单体上有多条N-H、O-H键和N、O原子，这样就会形成很多的氢键络合物，因此就需要把这些可能的构型都找到。我的做法是在不同的位置将两个单体放到一块，设计不同的初始构型，然后优化。但是我担心可能由于初始构型的摆放原因，有的氢键络合物可能漏掉。我想请教给位高手，为了避免有的氢键络合物漏掉，有没有好的方法或软件吗？谢谢了！ |
回复此楼» 猜你喜欢
2026第二届光电子与半导体器件前沿技术研讨会——光电子赋能·半导体创芯！
已经有1人回复
-
散金
已经有80人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有220人回复
-
光电子赋能·半导体创芯！
已经有1人回复
-
光电子赋能·半导体创芯！
已经有0人回复
-
浙江师范大学国家杰青杨启华教授团队招收2026年博士研究生
已经有32人回复
-
香港中文大学（深圳）2026年诚聘海内外优青
已经有0人回复
-
求助Cu2+1O的CIF文件(PDF: 05-0667)
已经有1人回复
-
QE计算电声耦合的时候报错Error in routine lambda (100)wrong or too many modes
已经有2人回复
-
KAUST（阿卜杜拉国王科技大学）MXene 器件方向博士后招聘
已经有0人回复
-
沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大学（KAUST）电池方向博士后招聘
已经有0人回复
yjcmwgk
禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
- QC强帖: 38
- 应助: 165 (高中生)
- 贵宾: 16.999
- 金币: 553.8
- 散金: 39880
- 红花: 395
- 沙发: 2
- 帖子: 10406
- 在线: 1528.1小时
- 虫号: 448368
- 注册: 2007-11-01
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 科研工具资源
2楼2009-07-16 15:55:57
snowliu2007
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2283.1
- 散金: 3413
- 红花: 8
- 帖子: 268
- 在线: 515.9小时
- 虫号: 418125
- 注册: 2007-07-02
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2009-07-17 08:07:57
zhou2009
版主 (著名写手)
- QC强帖: 15
- 应助: 337 (大学生)
- 贵宾: 4.053
- 金币: 42654.6
- 红花: 153
- 帖子: 1729
- 在线: 1274.7小时
- 虫号: 676800
- 注册: 2008-12-18
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
snowliu2007(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+10,VIP+0):谢谢 7-17 11:35
snowliu2007(金币+3,VIP+0): 7-17 14:57
snowliu2007(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+10,VIP+0):谢谢 7-17 11:35
snowliu2007(金币+3,VIP+0): 7-17 14:57
|
我近日为了作量子化学图形显示，也以氢键为例看了一下图形。 图形表明，是N、O原子的pi（孤对电子）作为电子给体，而H-O、H-N作为电子受体，实现少量电子转移，G03计算输出可以明确看到，形成氢键络合物的pi的MO的系数就是这样排布的，密度矩阵中对应的电子也是这样安排的。 于是可以观察氢键络合物生成前单体N、O原子的pi的HOMO，与氢键络合物生成前另一单体H-O、H-N的LUMO进行比较，因为正是这个HOMO的电子要有一点流向LUMO。 作为pi的MO，它自然是典型的P型轨道，有正负对称的两瓣。 H-O、H-N的LUMO怎样形成一个与pi对称性相同的轨道而起作用呢？ 这时是H-O、H-N中的原子各出一个S型轨道，且一正一负，构成一个位相与P型轨道相似的单体的LUMO，从而实现HOMO与LUMO的融合，实现电子pi少量转移，能量降低，形成氢键。 这些，并不是我的推测、猜想，而是对分别计算氢键络合物和单体，它们的MO明确表明的。 因此我想，可以对形成氢键络合物的两个单体分别作计算，观察HOMO与LUMO，去寻找可能的形成氢键部位。对于可以形成氢键的部位很多，就不止看HOMO与LUMO，其上其下还要去找。 对于目前使用较高基组这种看MO是不容易的，然而将HOMO与LUMO等的图形画出，就一目了然了，比看MO容易得多。 当然以上只是供参考的设想，对形成氢键的部位很多时，真作起来可能还是不那么容易。 [ Last edited by zhou2009 on 2009-7-28 at 11:36 ] |
4楼2009-07-17 10:17:56
snowliu2007
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2283.1
- 散金: 3413
- 红花: 8
- 帖子: 268
- 在线: 515.9小时
- 虫号: 418125
- 注册: 2007-07-02
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2009-07-17 14:58:25