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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】关于抑制剂同靶标之间的相互作用
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】关于抑制剂同靶标之间的相互作用

我有一个小分子与靶标的复合物晶体结构，小分子与靶标蛋白之间成共价键相互作用，请问用什么软件可以评价两者之间的相互作用（注意它们是共价键结合）？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:07 ]
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1楼2009-07-15 09:50:08
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428616

版主说的这个情况常见于酶接触反应体系中，是为了饱和QM末端原子的化学价但是成键后电子云分布与真实情况相差比较大，失真严重。可以用盖帽
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11楼2009-08-29 21:28:07
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
有谁能指点一下啊
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2楼2009-07-15 17:08:29
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lccbat

金虫 (初入文坛)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 7-16 12:23
这个很有趣，不过偶没有做过，呵呵
既然是键结合，按照分子势能计算两部分的相互作用，应该可以吧
好像不是很复杂
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3楼2009-07-16 11:24:47
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-16 13:16
既然是共价键，那就计算键能咯。
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4楼2009-07-16 13:00:53
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