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小RNA和基因序列比对
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大家好 我这里有个问题想请教大家。首先，我们有两个基因的序列，这两个基因中，一个是假基因（A基因），但是该基因是沉默的，不发生转录，而是具有发夹结构，编码小RNA，其编码的小RNA又以另一个基因（B基因）为靶基因，从而调节B基因的表达。还有一点要注意的是，A和B基因是同源基因，结构和序列很相似。然后我们做了小RNA测序。 以上是实验背景，我们的目的是想测A和B这两个基因的表达量，B基因表达量用荧光定量就可以测定。那A基因表达如何测定？ 听师兄的方法是：测得的小RNA序列比对到A和B这两个基因的序列上，看小RNA的比对的量，就可以表示该基因的表达量，而且要注意的是，因为A和B是同源基因，所以小RNA比对到A基因的量得到的结果可以用来表示A基因的表达量，小RNA比对到B基因的量得到的结果也可以用来表示A基因的表达量。 在这个地方我不懂，为什么是小RNA比对到B基因的量得到的结果也可以用来表示A基因的表达量，比对到B基因的量不是应该要表示B基因的表达量吗？？ |
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