| 查看: 3983 | 回复: 21 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者youxx189将赠送您 10 个金币 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
用ONIOM关键词算吸收，请问可以看分子轨道吗？ 已有1人参与
|
||
|
用ONIOM关键词算吸收，请问可以看分子轨道吗？得到的chk文件转化成fchk文件会造成数据丢失，在Gaussview里无法打开。 输入文件： %chk=packing1_guest_abs_ONIOM.chk %nprocshared=20 %mem=12000MB #p oniom(PBE1PBE/genecp td=(singlets,nstates=20,direct):uff)=embedcharge test absorption 0 1 0 1 0 1 C 26.8564499443,11.2974579201,22.535374973 L C 26.4312706227,12.5897273583,22.1656391631 L C 25.079756231,12.9545921491,22.2751903325 L C 24.1694372817,11.9921553489,22.7275839214 L C 24.5970630014,10.7317662379,23.1036871816 L C 25.9390511173,10.3569276904,23.0333609336 L H 27.8993300059,11.0327314821,22.4387729637 L 中间略到好多原子 C 33.1316875537,25.2458454493,20.5017776507 L H 34.6438528841,23.5215656048,22.9626666632 L H 34.5537458777,23.6020072384,20.5486274853 L C 33.0912226367,25.4397359482,19.0253450849 L O 33.7582638392,24.7213374764,18.3023322806 L O 32.3461046073,26.4006128366,18.4698156726 L C H N O 0 6-31G** **** Ir 0 LANL2DZ **** Ir 0 LANL2DZ |
回复此楼» 猜你喜欢
大湾区大学（筹）刘天辉课题组招收博士生（与中山大学物理学院联合培养）
已经有16人回复
-
PbS量子点如何确定浓度
已经有11人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有270人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
大湾区大学刘天辉课题组招收2026级博士生（与中山大学物理学院联合培养）
已经有22人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
PbS量子点紫外吸收
已经有0人回复
-
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已经有0人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
-
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生
已经有11人回复
-
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
送红花一朵 
14楼2020-06-23 17:57:35
wzhsun
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 281
- 散金: 50
- 帖子: 140
- 在线: 20小时
- 虫号: 13171742
- 注册: 2018-12-19
- 性别: GG
- 专业: 有机合成
2楼2020-06-22 11:38:10
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 587 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26383.1
- 红花: 349
- 帖子: 2025
- 在线: 1442小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
|
如果你的chk文件本身很大 比如说上G大小了 那转换一般会内存不够用导致出错。可以在环境变量里加上 export GAUSS_MEMDEF=4000000000 把内存调成可用4 GB应该就能解决问题。 TD计算chk文件中的分子轨道的信息就是基态分子轨道的信息 并没有什么特殊之处 发自小木虫IOS客户端 |
3楼2020-06-22 12:03:37
|
谢谢老师 我加了环境变量还是报错 [youxx@mu01 guest-abs]$ module unload gauss/g09d01 [youxx@mu01 guest-abs]$ module load gauss/g16a03 [youxx@mu01 guest-abs]$ export GAUSS_MEMDEF=4000000000 [youxx@mu01 guest-abs]$ formchk packing1ONIOM_dimer1-2.chk Read checkpoint file packing1ONIOM_dimer1-2.chk Write formatted file packing1ONIOM_dimer1-2.fchk Missing data for FChkPn. Error termination via Lnk1e at Mon Jun 22 13:36:29 2020. Error: segmentation violation rax 0000000000000000, rbx 0000000002b377e0, rcx ffffffffffffffff rdx 000000000001ef4c, rsp 00007ffe7319ed28, rbp 00007ffe7319ed80 rsi 000000000000000b, rdi 000000000001ef4c, r8 00002b4517b60ac0 r9 00002b4517b60ac0, r10 00007ffe7319e120, r11 0000000000000206 r12 000000000000000c, r13 0000000000000001, r14 0000000000000001 r15 0000000000000000 /lib64/libpthread.so.0(+0xf6d0) [0x2b4517d366d0] /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2b451827b547] formchk() [0x497ec9] formchk() [0x46f560] formchk() [0x46b8af] formchk() [0x453755] formchk() [0x4516a8] formchk() [0x450af4] /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2b4518267445] formchk() [0x4509e9] Aborted |
4楼2020-06-22 13:40:46
