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yjcmwgk禁虫 (文坛精英)
密度泛函·小卒
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[交流]
【讨论】关于某个键的键能,一个疑问
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求算某个键的键能,有些虫友给出一种方法。 对于反应“A断键,生成B和C”,求“断掉的那个键”的键能。 计算的过程 (1)优化断裂前A的结构,我知道这是必须的。 (2)优化断裂后B、C的结构 (3)BSSE校正 (4)按照公式E=E(B)+E(C)-E(A),E就是“断掉的那个键”的键能 但是,我认为,这样算出来的E,我觉得是这个整个反应的解离能,而不是“断掉的那个键”的键能。 至少是这样的:在断键的前后,“断掉的那个键”的周围的一些键,肯定有所变化,这样,上述公式算出来的E就包含了别的键的键能的变化——尽管别的键没有断裂,但是它们的键能一定也变了。 想求某一个特定的键的能量,我现在猜——能不能把其余的原子全变成Bq原子,只保留要关注的那个键的两端的原子?然后再用E=E(B)+E(C)-E(A),算出的E,才是真正的键能。你们觉得对吗? 抛砖引玉,各位高手讨论一下? 看了yytsnake大侠的回帖,我想问另一个问题,这个问题我已经想了很久了,但是一直讲不清楚,毕竟这个疑问太过于匪夷所思。我尽量描述清楚,不过未必有这个能力,还请大家多多理解: 我还有疑问就是:"键能"这个概念,是真实存在的吗? 我们习惯于在两个原子间画一条线(或者两条线,一条实线一条虚线,甚至三条实线,各种表示方法,不一而足),但是这条线并不反映真实存在,是虚构的,是对真实物理图景的一种相当粗糙的近似,是很不严谨的概念。这一点我还是能确定的。——这是一句废话,如果我连这个都不知道,我就不用在Gaussian版混了。 分子的形成,不过就是一群带正电的粒子(原子核)和更多的带负电的粒子(电子)之间的相互作用,而形成的“原子核--电子”粒子团。由于正负电荷相互吸引,这个粒子团有一种向心力,向心力能使这个粒子团凝聚;由于正正电荷之间的相互排斥,和负负电荷之间的相互排斥,这个粒子团有一种外推力,外推力能使这个粒子团散开。凝聚和散开,两种作用,相互平衡,这个分子也就稳定了。 我们谈论某个特定的化学键的“键能”,前提是——我们能确切知道这个键(或者说键的两端的原子)拥有多少电子,拥有哪些类型的电子(比如说,拥有2号原子的2PX轨道上的电子,其组合系数是0.1000;还拥有7号原子的3D(x2-y2)电子,其组合系数是0.0500,等等等等,这也是NBO的宗旨之一:将电子划分给原子)。但是,习惯上,将电荷人为地划分给原子(另一种表述:将电子人为地划分给键;第三种表述:某个键是由哪些原子的那些原子轨道以什么系数组合而成的。我觉得这三种表述是一种思想),这种思想本身就是有很大问题的!我认为这种思想根本不反映客观存在。 [ Last edited by yjcmwgk on 2009-7-7 at 15:51 ] |
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键,肯定是真实存在的(在当前对键的定义前提下)。键能也肯定是有的(其大小应该视键能是如何定义的)。 如果按照目前比较流行的有关键能的定义,应该是算分子的能量与键断裂后生成的两个自由基(或原子)的能量差值。 这可能有两种情况,一是所谓的垂直键能(自己瞎定义的),即以快刀斩乱麻形式断开键,这时所有结构可以看作是来不及变化的,保持不变,计算时利用优化后的分子结构残片生成自由基并计算其单点能,进而计算这种键能。 另一种情况是键逐渐被拉长,最后断裂。是不是可以利用指定键的势能面扫描结果来得到键能?(这里可能涉及到电子对拆开的能量)。 菜鸟之菜论,还望高手、大侠指点迷津。 |
3楼2009-07-07 15:34:54
yytsnake
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4楼2009-07-07 15:50:05
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