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【求助】如何找到最稳定的分子构型
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在对一个分子构型进行优化时，加入iop（1/8=1）是不是每步优化时的步长都是0.01波尔半径呢？还有人说要使优化的每步的步长值都为固定值，除了要加iop（1/8=1）外，还要加上opt（notrustupdate），哪位大侠知道是哪一种呢？ 这样优化是不是更容易得到如何找到最稳定的分子构型呢？ |
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8楼2009-07-08 16:19:20
yytsnake
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寻找最稳定结构的重点不在于优化时的设置，而在于建立模型时初始结构的合理性。如果这个初始结构不合理，什么设置都是白说。对于一个体系，可能存在的能量谷值有很多，它们之间也可能有较高的能垒，就象你爬到一个山顶，一眼望去，有很多山谷，哪个才是你要的最深的山谷？随便找一个下去看看？掉进去也许就很难再出来了。最可能的方法就是你所站的位置下方就是你要去的山谷，或者你就站在通往这山谷的斜坡上，稍一挪动位置自己就滚了下去，这最省事。 至于优化设置，是指当这个山谷太平坦，最低点不太好找时才需要。 |
2楼2009-07-07 11:18:13
3楼2009-07-08 14:36:43
yytsnake
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4楼2009-07-08 14:52:00