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【求助】如何找到最稳定的分子构型
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在对一个分子构型进行优化时,加入iop(1/8=1)是不是每步优化时的步长都是0.01波尔半径呢?还有人说要使优化的每步的步长值都为固定值,除了要加iop(1/8=1)外,还要加上opt(notrustupdate),哪位大侠知道是哪一种呢? 这样优化是不是更容易得到如何找到最稳定的分子构型呢? |
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yytsnake
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4楼2009-07-08 14:52:00
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寻找最稳定结构的重点不在于优化时的设置,而在于建立模型时初始结构的合理性。如果这个初始结构不合理,什么设置都是白说。对于一个体系,可能存在的能量谷值有很多,它们之间也可能有较高的能垒,就象你爬到一个山顶,一眼望去,有很多山谷,哪个才是你要的最深的山谷?随便找一个下去看看?掉进去也许就很难再出来了。最可能的方法就是你所站的位置下方就是你要去的山谷,或者你就站在通往这山谷的斜坡上,稍一挪动位置自己就滚了下去,这最省事。 至于优化设置,是指当这个山谷太平坦,最低点不太好找时才需要。 |
2楼2009-07-07 11:18:13
3楼2009-07-08 14:36:43
yytsnake
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5楼2009-07-08 15:02:39












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