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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】structure factor S(q)的问题 已有2人参与

看好多文献上都有structure factor 这个量的分析,但是一直不知道是怎么做出来的,定义也都不一样。看书上好像是对g(r)积分然后再乘上密度啥的。
这个量gmx或者namd有现成的程序可以做吗?或者是要自己做福利叶变换?
还有个问题,这个量是对于某种分子来说的呢,还是对于整个体系呢?我看有的图是分析一种的,还有的图也没指明。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:22 ]
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yipan01

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 海边看日出 at 2009-07-06 11:45:22:
结构因子(structure factor)是表征材料对射线的散射能力,包括了原子序数,散射方向和原子位置的影响等等,反映了材料结构的平均信息。实验中可以获得结构因子,通过傅立叶变换获得径向分布函数(RDF)。分子模 ...

赞,学习了
5楼2010-11-17 18:57:58
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suny2005

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-6 11:50
gromacs中有g_rdf -sq
应该既能分析整个体系,又能分析局部
2楼2009-07-05 18:08:09
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海边看日出

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 7-6 11:50
结构因子(structure factor)是表征材料对射线的散射能力,包括了原子序数,散射方向和原子位置的影响等等,反映了材料结构的平均信息。实验中可以获得结构因子,通过傅立叶变换获得径向分布函数(RDF)。分子模拟则相反,先获得RDF,再通过变换获得结构因子。

不知道你说的对某个分子是什么意思,是不是指偏径向分布函数(partial RDF)?模拟很容易计算。实验就比较麻烦,得看你的成分。比如说合金(两种元素),就得三组不同实验(X-ray,中子和电子),然后才能计算partial RDF。

就知道这么多了,不对的地方欢迎讨论。

[ Last edited by 海边看日出 on 2009-7-6 at 11:46 ]
3楼2009-07-06 11:45:22
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qzhaosdu

金虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by 海边看日出 at 2009-7-6 11:45:
结构因子(structure factor)是表征材料对射线的散射能力,包括了原子序数,散射方向和原子位置的影响等等,反映了材料结构的平均信息。实验中可以获得结构因子,通过傅立叶变换获得径向分布函数(RDF)。分子模 ...

这个东东。。。RDF是原子之间或者分子质心之间的性质吧。。。那S。。。
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4楼2009-07-07 00:36:21
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