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staphlee金虫 (正式写手)
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[交流]
OH的氢不在氢键的路径上...怎解决??(已解決,感谢xi2004大师帮我修正指导)
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??λ??? ???????????? ???е?OH?????????????? ????H?????????·???? ??????????? ???и?????,?????????????????????????? ?????????? ?п???????Щ???? ?????????cif, res, ins?? ????????? http://d.namipan.com/d/ba870b461 ... 9c574feeb46242d0000 http://d.namipan.com/d/b235b7e9b ... dee05bc8589660a0000 http://d.namipan.com/d/507c4e4af ... 37c07c3a6701a110000 ps. ?@???Y????????w?????????????K??????????...???d????????^?????? http://15151.5d6d.com/forum-184-1.html [ Last edited by staphlee on 2009-7-6 at 10:56 ] |
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
waiy2001(金币+3,VIP+0):谢谢哟,呵呵 7-6 12:39
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帮你改好了. 问题和解决办法 1. H不在氢键的路径上 PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O1 - H1A ... ? 不要用理论加氢, 这个羟基上的氢明明可以从DIF-fourier map上找到, 为何要理论加. 利用残余峰找到H以后, 可适当修正. 并可在xp中利用himp的指令,是O-H更合理些. 如himp 0.85 h1 2. PLAT413_ALERT_2_A Short Inter XH3 .. XHn H6B .. H6B .. 1.89 Ang. PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X H1A .. H6C .. 1.73 Ang. 这个是同样的问题. 要先从Dif-fmap上找到CH3上的几个H, 然后再到.ins中, 使用AFIX 137 3. PLAT043_ALERT_1_A Check Reported Molecular Weight ................ 369.04 PLAT051_ALERT_1_A Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by . 59.68 Perc. 这个是分子式还不对. Z值也不对 等你原子全部找到后, 在.ins中加 acta 指令, 然后查看 .lst中, 看看 其提示的正确的分子式, 然后, 直接改动.ins中的 unit 一行. SFAC C H N O CL PT UNIT 24 36 12 12 4 2 4. THETM01_ALERT_3_B The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.575 Calculated sin(theta_max)/wavelength = 0.5554 这个结构就不要用omit了. 应用用不用数据完整度差不多的. 6. 还有个问题,我解出来的这个结构的原子怎都扁扁的 你的椭球还好啦. 扁不扁不靠肉眼, 要看platon, shelx有没有提示. 7. 原子标号重新改了一下, 只是我的习惯问题, 可能不一定对. 最后, 请crystalsnet指正. |
4楼2009-07-06 10:17:54
staphlee
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5楼2009-07-06 10:58:07