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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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staphlee

金虫 (正式写手)

[交流] OH的氢不在氢键的路径上...怎解决??(已解決,感谢xi2004大师帮我修正指导)

??λ???
????????????
???е?OH??????????????
????H?????????·????
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???и?????,??????????????????????????
??????????
?п???????Щ????
?????????cif, res, ins??
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http://d.namipan.com/d/ba870b461 ... 9c574feeb46242d0000

http://d.namipan.com/d/b235b7e9b ... dee05bc8589660a0000

http://d.namipan.com/d/507c4e4af ... 37c07c3a6701a110000

ps. ?@???Y????????w?????????????K??????????...???d????????^??????
   http://15151.5d6d.com/forum-184-1.html

[ Last edited by staphlee on 2009-7-6 at 10:56 ]
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staphlee

金虫 (正式写手)

这么多人怎没人帮我看一下呢
拜托拜托
2楼2009-07-05 18:08:03
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staphlee

金虫 (正式写手)

我自己頂一下
3楼2009-07-06 09:25:29
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
waiy2001(金币+3,VIP+0):谢谢哟,呵呵 7-6 12:39
帮你改好了.

问题和解决办法

1. H不在氢键的路径上
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor       O1     -   H1A    ...          ?   

不要用理论加氢,
这个羟基上的氢明明可以从DIF-fourier map上找到, 为何要理论加.
利用残余峰找到H以后, 可适当修正.
并可在xp中利用himp的指令,是O-H更合理些.
如himp 0.85 h1

2.

PLAT413_ALERT_2_A Short Inter XH3 .. XHn     H6B    ..  H6B     ..       1.89 Ang.
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X       H1A    ..  H6C     ..       1.73 Ang.

这个是同样的问题. 要先从Dif-fmap上找到CH3上的几个H,
然后再到.ins中, 使用AFIX 137

3.
PLAT043_ALERT_1_A Check Reported Molecular Weight ................     369.04      
PLAT051_ALERT_1_A Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by .      59.68 Perc.


这个是分子式还不对. Z值也不对
等你原子全部找到后, 在.ins中加 acta 指令,
然后查看 .lst中, 看看 其提示的正确的分子式,
然后, 直接改动.ins中的  unit 一行.
SFAC C H N O CL PT
UNIT 24 36 12 12 4 2

4.
THETM01_ALERT_3_B  The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.575
            Calculated sin(theta_max)/wavelength =    0.5554


这个结构就不要用omit了.
应用用不用数据完整度差不多的.

6. 还有个问题,我解出来的这个结构的原子怎都扁扁的

你的椭球还好啦.
扁不扁不靠肉眼,
要看platon, shelx有没有提示.

7. 原子标号重新改了一下, 只是我的习惯问题, 可能不一定对.

最后, 请crystalsnet指正.
xi2004-emuch@163.com
4楼2009-07-06 10:17:54
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staphlee

金虫 (正式写手)

谢谢xi2004老师....你实在太厉害了
最近刚开始学解晶体
在这个版面看到许多人问你问题
你实在太热心了
感谢你
有问题我在麻烦你了....谢谢
5楼2009-07-06 10:58:07
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