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mshappy5888

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 713042
注册: 2009-03-02
专业: 生物大分子结构与功能

[交流] 【求助】力场文件问题

ffamber99sbbon.itp文件里的
[ bondtypes ]
; i j  func    b0       kb
  C  C       1    0.1525 259408.0 ; new99
  C  OS       1    0.1323 376560.0 ; new99
中bo  kb  func 分别代表什么意思  ？
[ angletypes ]
;  i j k  func    th0    cth
HW  OW  HW          1 104.520 836.800 ; TIP3P water
HW  HW  OW          1 127.740    0.000 ; (found in crystallographic water with 3 bonds)
C C O          1 120.000 669.440 ; new99
C C OH          1 120.000 669.440 ; new99
中th0 cth分别代表什么？
在gromacs自带的力场力例如ffG43a1里 ffG43a1bon.itp文件里
ICB(H)[N] CB[N] B0[N]
;
#define gb_1       0.1000  1.5700e+07
; H  -  OA    750
  ICB(H)[N] CB[N] B0[N]代表什么意思？  750代表什么  怎么得出来的？
还有这2个文件中的参数有什么对应关系么？
由于本人对力场里的这些文件不太明白，还请明白人给详细讲解下，万分感谢！！！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:19 ]

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