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【求助】力场文件问题
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ffamber99sbbon.itp文件里的 [ bondtypes ] ; i j func b0 kb C C 1 0.1525 259408.0 ; new99 C OS 1 0.1323 376560.0 ; new99 中bo kb func 分别代表什么意思 ？ [ angletypes ] ; i j k func th0 cth HW OW HW 1 104.520 836.800 ; TIP3P water HW HW OW 1 127.740 0.000 ; (found in crystallographic water with 3 bonds) C C O 1 120.000 669.440 ; new99 C C OH 1 120.000 669.440 ; new99 中th0 cth分别代表什么？ 在gromacs自带的力场力例如ffG43a1里 ffG43a1bon.itp文件里 ICB(H)[N] CB[N] B0[N] ; #define gb_1 0.1000 1.5700e+07 ; H - OA 750 ICB(H)[N] CB[N] B0[N]代表什么意思？ 750代表什么 怎么得出来的？ 还有这2个文件中的参数有什么对应关系么？ 由于本人对力场里的这些文件不太明白，还请明白人给详细讲解下，万分感谢！！！ [ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:19 ] |
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