24小时热门版块排行榜    

查看: 1346  |  回复: 4

秦紫蓉

新虫 (初入文坛)

[求助] DNA序列上传NCBI问题求解

在NCBI上传动物COI序列后收到NCBI如下邮件,望有经验前辈赐教,该如何解决。本人比较外行,DNA提取扩增后都是由测序公司测序拼接的,对基因序列中存在的问题也不太清楚。NCBI邮件如下:
We have received the following 57 sequence submissions from you:

SUB7027792 :  (57)

Some or all of the protein coding sequences contain reading frame shifts
(insertions/deletions based on BLAST similarity search results and/or an
alignment), and/or have translations that show little or no similarity
to other proteins in the database.

This generally indicates problems such as:

  - errors in the nucleotide sequence
  - sequences have not been trimmed of low quality
  - problems with feature annotation which may be due to:
        translation in the wrong reading frame or on the wrong strand
        translation does not have the correct exon spans
        translation includes noncoding sequence, such as introns or UTR's

Provide a corrected submission file through the Submission Portal:
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

年少轻狂xf

新虫 (正式写手)

2楼2020-04-07 00:51:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weebug

版主 (著名写手)

序列上有增减,导致转译到蛋白氨基酸时发生错误。
天蓝蓝兮日头晒
3楼2020-04-07 09:58:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KelvinLeo

新虫 (小有名气)

可以参考文库教程搜索"编码蛋白质的基因序列提交”

发自小木虫Android客户端
4楼2021-03-24 15:09:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

尛哲仙聖

新虫 (初入文坛)

我也出现了这种情况 不知道该如何处理了
5楼2023-07-12 17:53:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 秦紫蓉 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856化工原理 +4 z2839474511 2026-03-10 4/200 2026-03-11 16:49 by 2020015
[考研] 0703求调剂 +4 jtyq001 2026-03-10 4/200 2026-03-11 09:15 by @飒飒飒飒
[考研] 282分材料专业求调剂院校 +16 枫桥ZL 2026-03-09 23/1150 2026-03-11 08:31 by 学员8dgXkO
[考研] 标题:捡漏预警|08工科/09农学调剂!英语要求低,过线即有机会! +7 马超放烟花 2026-03-07 12/600 2026-03-10 23:16 by Equinoxhua
[考研] 308求调剂 +4 是Lupa啊 2026-03-08 7/350 2026-03-10 18:25 by 清风月
[考研] 材料工程专硕调剂自荐信,初试323 +6 李白26 2026-03-07 6/300 2026-03-10 16:16 by 无际的草原
[考研] 一志愿天大化工(085600)调剂总分338 +5 蔡大美女 2026-03-09 5/250 2026-03-10 14:44 by ruiyingmiao
[考研] 材料与化工 一志愿山大 321分 求调剂 +6 每天散步 2026-03-09 7/350 2026-03-10 10:52 by 星空星月
[考研] 环境调剂 +5 晓看天暮看云 2026-03-09 5/250 2026-03-10 10:46 by 星空星月
[考研] 085701环境工程295求调剂,一志愿A区211 +8 等春来, 2026-03-06 9/450 2026-03-10 10:38 by 沙漠之狐994
[考研] 0856求调剂 +3 squirtle11 2026-03-07 3/150 2026-03-09 09:54 by @飒飒飒飒
[考博] 26年博士申请 +4 科研狗111 2026-03-07 4/200 2026-03-08 21:56 by 0611517sll
[考研] 301求调剂 +11 朝天椒的双马尾 2026-03-05 11/550 2026-03-08 21:50 by 知足常乐的乐
[考研] 269求调剂 +3 朔朔话 2026-03-08 4/200 2026-03-08 20:39 by 热情沙漠
[考研] 303求调剂 +8 forgman95 2026-03-05 10/500 2026-03-08 12:41 by 蓝莓都给你
[考研] 322分 085600求调剂,有互联网+国金及主持省级大创经历 +4 熊境喆 2026-03-05 4/200 2026-03-07 22:04 by 星空星月
[考研] 求调剂 +4 呼呼?~+123456 2026-03-05 5/250 2026-03-06 23:15 by L135790
[考研] 275求调剂 +4 大爆炸难民 2026-03-06 5/250 2026-03-06 09:21 by guoweigw
[考研] 材料与化工304求调剂 +7 邱gl 2026-03-05 10/500 2026-03-06 01:11 by 卷柏卷柏
[考研] 考研282分求调剂,接受跨专业 +4 刘淄博 2026-03-04 7/350 2026-03-05 22:56 by 刘淄博
信息提示
请填处理意见