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含草

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于VASP运行

大家好,为什么我建好四个文件之后,还有job.sh,用qsub提交之后,没有几秒钟就算好了,但是输出文件里面全是空的,请问这是怎么回事?谢谢
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含草

金虫 (小有名气)

这是我的job.sh文件
#PBS -N name
### Set the number of nodes that will be used. Ensure
### that the number "nodes" matches with the need of your job
### DO NOT MODIFY THE FOLLOWING LINE FOR SINGLE-PROCESSOR JOBS!
#PBS -l nodes=2:ppn=2
#PBS -l walltime=240:00:00
#PBS -q verylong
###PBS -M zhaoyj@scut.edu.cn
#PBS -m abe
export NPROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE |gawk '//{print $1}'`
echo $NPROCS
echo The master node of this job is `hostname`
echo The working directory is `echo $PBS_O_WORKDIR`
echo The node file is $PBS_NODEFILE
echo This job runs on the following $NPROCS nodes:
echo `cat $PBS_NODEFILE`
echo "=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-"
echo
echo command to EXE:
echo
echo
cd $PBS_O_WORKDIR

"job.sh" 27L, 803C
10楼2009-07-01 20:00:12
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查看全部 11 个回答

y1ding

铁杆木虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
这得问你们机器的管理员
你就没有运行vasp吧
2楼2009-06-30 09:43:48
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qphll

金虫 (正式写手)

★
yjr(金币+1,VIP+0):多谢交流 6-30 21:52
请查看两个out文件,一个是qsub对应的输出文件,LSF有默认的out和err文件输出在当前计算文件夹
另外,通过查看vasp程序的out文件,也能知道是怎么一回事.
Life, Love, Laugh.
3楼2009-06-30 14:54:27
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lerry1234

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
是不是jod.sh脚本中没有写把结果输出到本文件夹下的OUTCAR文件?
4楼2009-06-30 18:03:31
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