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含草金虫 (小有名气)
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【求助】关于VASP运行
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| 大家好，为什么我建好四个文件之后，还有job.sh，用qsub提交之后，没有几秒钟就算好了，但是输出文件里面全是空的，请问这是怎么回事？谢谢 |
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y1ding
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2楼2009-06-30 09:43:48
qphll
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3楼2009-06-30 14:54:27
4楼2009-06-30 18:03:31
含草
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其中7054.chess_254.chess.out 文件中出现以下情况， running on 4 nodes distr: one band on 4 nodes, 1 groups vasp.4.6.31 08Feb07 complex p3_32458: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11 rm_l_3_32460: (0.019531) net_send: could not write to fd=5, errno = 32 p2_32453: p4_error: interrupt SIGSEGV: 11 rm_l_2_32459: (0.019531) net_send: could not write to fd=5, errno = 32 p2_32453: (0.019531) net_send: could not write to fd=5, errno = 32 p0_27916: p4_error: interrupt SIGx: 13 p3_32458: (2.019531) net_send: could not write to fd=5, errno = 32 p0_27916: (6.300781) net_send: could not write to fd=4, errno = 32 请问这是什么原因，所有的输入文件全是空的 |
5楼2009-06-30 21:51:41
qphll
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6楼2009-06-30 22:02:31
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7楼2009-07-01 09:14:31
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8楼2009-07-01 12:29:02
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9楼2009-07-01 12:29:35
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这是我的job.sh文件 #PBS -N name ### Set the number of nodes that will be used. Ensure ### that the number "nodes" matches with the need of your job ### DO NOT MODIFY THE FOLLOWING LINE FOR SINGLE-PROCESSOR JOBS! #PBS -l nodes=2:ppn=2 #PBS -l walltime=240:00:00 #PBS -q verylong ###PBS -M zhaoyj@scut.edu.cn #PBS -m abe export NPROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE |gawk '//{print $1}'` echo $NPROCS echo The master node of this job is `hostname` echo The working directory is `echo $PBS_O_WORKDIR` echo The node file is $PBS_NODEFILE echo This job runs on the following $NPROCS nodes: echo `cat $PBS_NODEFILE` echo "=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-=-" echo echo command to EXE: echo echo cd $PBS_O_WORKDIR "job.sh" 27L, 803C |
10楼2009-07-01 20:00:12