应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助】菌种鉴定
51/1返回列表
查看: 1045  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhanghui9211

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】菌种鉴定

请问有谁做过NCBI菌种鉴定的，我现在已经得到序列了，但不知道如何进行网上比对！望有详细步骤，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-06-29 22:00:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

haichang

银虫 (小有名气)
★
amisking(金币+1,VIP+0):欢迎发帖交流！ 7-9 22:19
在NCBI中找到最高相似度的菌株
把该菌株所在的属的所有模式菌株的16S序列全部下载下来
然后用相关软件做系统进化树
赞一下(6人) 回复此楼
时不我待
9楼2009-07-09 21:55:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

figo.339

木虫 (著名写手)
★
zhanghui9211(金币+1):谢谢参与
NCBI blast分析应该可以吧！
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-06-29 22:10:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lifeip

至尊木虫 (知名作家)
★
zhanghui9211(金币+1):谢谢参与
把所获序列进行blast比对，Blast网页： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi。 找到核酸或蛋白blast，   把序列输进去（可黏贴），选择Database，点击Blast，等结果。看有无一致或相似结果？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-06-29 22:10:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liangzb

新虫 (初入文坛)

关于菌株鉴定

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流！ 7-9 22:19
在blast里边比对发现属于哪个属后 权威的做系统发育树所要参考的菌属信息就需要在TaxBrowser上输入可以确定的菌属名称 然后点击进入 和里边列出的已经发表在权威菌种鉴定的杂志上 一般是IJSEM这个杂志上的同属的菌株的序列进行系统发育树分析 一般Blast里边的好多比对信息不可信 因为提交的很多 都是简单的初步鉴定 若是新种杂志上的就可以完全参考了
赞一下(7人) 回复此楼
4楼2009-06-29 23:27:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭