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田园1983

木虫 (正式写手)

[交流] 发金币求助--磷酸化蛋白检测问题

我的实验目的:
检测病人和正常人外周血淋巴细胞中某蛋白磷酸化水平的差异

我要检测的蛋白有一个酪氨酸磷酸化位点,本来打算通过elisa和western的方法检测,但是没有查到商品化的用来测该蛋白磷酸化的kit和抗体。好像有商品化的酪氨酸磷酸化抗体,能不能用来测我的目的蛋白?如果可以的话,怎么做呢?或者有没有其他解决办法?

从来没有做过蛋白磷酸化检测,周围人也没有了解这方面的,请虫友们多多提宝贵意见!小女子跪谢啦!

[ Last edited by 350784478 on 2009-8-5 at 20:57 ]
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yyn0452

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
田园1983(金币+10,VIP+0): 6-27 22:13
田园1983(金币+10,VIP+0): 6-27 22:29
先加磷酸化抗体,
然后strip, 再加普通抗体,暴总蛋白
2楼2009-06-27 17:18:42
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aaaaaa1380

至尊木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
amisking(金币+3,VIP+0):哈哈,最近还真比较活跃啊|! 6-27 22:42
田园1983(金币+10,VIP+0):非常感谢! 6-27 22:54
强烈建议用质谱(MS)方法检测,灵敏度高,特别对氨基酸修饰检测特别合适(如果知道该蛋白质的全序列,那就最好了),因为如果发生磷酸化,相应的质谱峰m/z会发生+91 迁移。另外做质谱价格肯定比抗体Kit便宜不少。许多公司都可以做。
具体过程如下:
如果你是跑胶得到的蛋白,可以用胰酶进行胶内酶切, 然后对酶切得到的肽段进行MS鉴定(MALDI-TOF MS 或者ESI-MS),包括一级谱,二级谱,通过相应肽段的二级谱解谱,就可以鉴定出你要的磷酸化位点。
如果你得到的蛋白在溶液中,可以进行溶液酶切,一下过程如上所述。

祝实验顺利!!!
3楼2009-06-27 22:38:59
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
田园1983(金币+10,VIP+0):谢谢啦! 6-27 22:54
但是质谱法需要纯化蛋白,前期步骤繁琐
用western比较好
真的没有相应的磷酸化抗体?
都查了哪些试剂公司呢?
4楼2009-06-27 22:50:24
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田园1983

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by aaaaaa1380 at 2009-6-27 22:38:
强烈建议用质谱(MS)方法检测,灵敏度高,特别对氨基酸修饰检测特别合适(如果知道该蛋白质的全序列,那就最好了),因为如果发生磷酸化,相应的质谱峰m/z会发生+91 迁移。另外做质谱价格肯定比抗体Kit便宜不少。 ...

我要检测的是已知的蛋白,主要目的是看病人和正常人的该蛋白的磷酸化水平,如果给公司做质谱的话,可以定量吗?我是不是只要把这个蛋白纯化出来就好了?
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5楼2009-06-27 22:59:30
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田园1983

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2009-6-27 22:50:
但是质谱法需要纯化蛋白,前期步骤繁琐
用western比较好
真的没有相应的磷酸化抗体?
都查了哪些试剂公司呢?

我是在bioconpare上搜索的,没有看见有公司卖这个蛋白的磷酸化检测的抗体。但是我自己觉得,如果用非特异的只针对酪氨酸位点磷酸化的抗体可以吗?
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6楼2009-06-27 23:02:11
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aaaaaa1380

至尊木虫 (知名作家)

质谱可以做定量,相对定量现在已经相对比较成熟,也有做绝对定量的,只要你纯化出来你要的蛋白质,应该就可以做,具体你可以问问一些质谱公司,比如说bruker公司、瓦里安等等
7楼2009-06-27 23:13:26
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by 田园1983 at 2009/6/27, 23:02:


我是在bioconpare上搜索的,没有看见有公司卖这个蛋白的磷酸化检测的抗体。但是我自己觉得,如果用非特异的只针对酪氨酸位点磷酸化的抗体可以吗?

那样子还是得把目的蛋白纯出来才行……
你可以去CST、Abcam、Santa Cruz等网站查
biocompare不一定能够面面俱到~~~
8楼2009-06-27 23:19:58
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aaaaaa1380

至尊木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
田园1983(金币+10,VIP+0):谢谢! 6-28 18:45
请问楼主要检测的蛋白在人体内含量怎么样,如果是高丰度蛋白质,一般电泳就应该能分离出来,如果含量低可以做液相纯化,当然也可以做免疫共沉淀抓取你要的蛋白,质谱的最大的好处就是灵敏度高,检测极限飞摩尔级、ng级别。。。

当然用抗体也不错,只要有合适的坑体,上面的虫友说的也很好,楼主自己可以多看几个公司,应该有合适的抗体。两种方法都可以试试

祝实验顺利吧
9楼2009-06-27 23:33:05
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cauzhangtao

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
田园1983(金币+10,VIP+0):谢谢! 6-28 18:45
我觉得用质谱法比较好,现在 的抗体应该不好弄。
10楼2009-06-28 00:08:45
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