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XM沐沐

新虫 (小有名气)

[求助] 关于质粒重组,请教大佬们~ 已有2人参与

合成的引物,退火用klenow fragment补齐,酶切后用T4连接酶插入到相同酶切的质粒中,通过DH5α转化,没有菌落长出,是什么问题啊?是质粒重组没有连接上么?
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雨独步

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
XM沐沐: 金币+10, ★★★很有帮助 2020-01-17 17:01:37
如果平板抗性没错的话,一般即使自连或者载体没切干净也会长几个,感受态的效率有问题吗?另外,看你的描述是想将一个很小的片段连到载体上,那为什么不把这个片段设在引物5'端,引物3'端是载体上的片段(正反向引物用同样的酶切位点),然后扩增出整个载体片段,回收后酶切自连。
2楼2020-01-16 13:03:42
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liling0601

铜虫 (小有名气)

退火用klenow fragment补齐。这句话什么意思,没看懂,这是指扩增的酶的名字,还是大肠杆菌DNA聚合酶的其中一个大片段 有5'->3'的聚合酶活性和3'->5'的外切酶活性 的片段?
3楼2020-01-17 13:32:24
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

导致没有菌生长的原因有很多,比如,片段酶切处理不完全、载体处理不完全、连接效率过低、感受态细胞效率低下等等。如果想找到原因还是建议做一些对照实验,比如可以用空载转感受态,验证感受态细胞效率,通过载体自连转化验证载体处理效果等。
    大家经常面对的是假阳性比较多,即载体自连。对于楼主出现的连一个菌都不长的情况,首先确定平板抗性正确,然后使用空载体进行转化,验证感受态细胞的效率,当然如果感受态细胞其他人用着可以,那就不用做该对照。
    不太清楚楼主的实验目的,描述的比较简单,且“合成的引物,退火用klenow fragment补齐”是pcr扩增基因产物?我没做过,所以不太清楚表达的意思。
    其实转化的主要因素就是:片段、载体、连接体系
    pcr片段进行酶切时候,最容易出现酶切不完全的情况,因为切下来的碱基少,电泳无法分辨。可以考虑连接T载体后,提取质粒进行酶切,这样可以通过电泳检测片段是否酶切完全。
    载体也同样存在酶切是否完全的问题,特别双酶切的时候,很多判断是否两个酶都酶切完全。这时候我们一般会适当的增加酶量和时间,但这一般不会导致一个菌都不长,会出现载体自连情况。
    接下来就是连接,我建议在进行片段和载体连接前,一定进行电泳检测你的片段和载体浓度,因为我们之前就出现过,对片段载体胶回收后进行连接效率很低,后来发现回收的片段浓度电泳都看不到,所以根据经验,还是做个电泳检测,如果片段浓度可以,那就尽量多的加入片段,载体有一点即可,可以增加转化子的阳性数。
天空才是极限,我有信心飞的更高!
4楼2020-04-08 14:26:18
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