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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】【求助】关于分子碎片生长

谁能给推荐一款分子碎片生长的程序,最好是linux下的,而且输入文件最好是pdb或mol2.
就是将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子。先谢谢啦
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★ ★ ★
gwdavid(金币+2,VIP+0): 哈哈,老汉好点子 7-7 20:07
wuhanhgf2002(金币+2,VIP+0): 7-13 08:45
引用回帖:
Originally posted by whitewatercn at 2009-7-7 08:43:
RDKit不错啊,至少从源代码风格上,似乎比OpenBabel和CDK要爽一些。未深入研究哈。作为搞化学信息学的人来讲,有了一个设计得比较好的Molecule类,你几乎可以实现任何想法。

眼馋咯?不如你们几个家伙组织组织,编一个EMuchChem吧。
16楼2009-07-07 17:11:18
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢交流 6-24 12:15
将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子

我完全没看明白——难道是我理解有误?我发誓GV完全可以做到这一点
2楼2009-06-24 11:10:04
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Derchief

金虫 (正式写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 12:15
引用回帖:
Originally posted by wuhanhgf2002 at 2009-6-24 11:07:
谁能给推荐一款分子碎片生长的程序,最好是linux下的,而且输入文件最好是pdb或mol2.
就是将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子。先谢谢啦

俺也觉得是。。。gv高级技巧 呵呵
God is a mac.
3楼2009-06-24 11:53:55
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 18:22
北大来鲁华课题组开发的程序,好像可以。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2009-06-24 12:49:06
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