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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】【求助】关于分子碎片生长

谁能给推荐一款分子碎片生长的程序，最好是linux下的，而且输入文件最好是pdb或mol2.
就是将一个分子碎片固定，然后和若干个碎片连接，新的碎片替代原来碎片上的氢原子，然后生成新的分子。先谢谢啦
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1楼 2009-06-24 11:07:42
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢交流 6-24 12:15
将一个分子碎片固定，然后和若干个碎片连接，新的碎片替代原来碎片上的氢原子，然后生成新的分子

我完全没看明白——难道是我理解有误？我发誓GV完全可以做到这一点
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2楼2009-06-24 11:10:04
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Derchief

金虫 (正式写手)
★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 12:15
引用回帖:
Originally posted by wuhanhgf2002 at 2009-6-24 11:07:
谁能给推荐一款分子碎片生长的程序，最好是linux下的，而且输入文件最好是pdb或mol2.
就是将一个分子碎片固定，然后和若干个碎片连接，新的碎片替代原来碎片上的氢原子，然后生成新的分子。先谢谢啦

俺也觉得是。。。gv高级技巧 呵呵
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God is a mac.
3楼2009-06-24 11:53:55
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★
yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 18:22
北大来鲁华课题组开发的程序，好像可以。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
4楼2009-06-24 12:49:06
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-26 13:19
引用回帖:
Originally posted by Derchief at 2009-6-24 11:53:
俺也觉得是。。。gv高级技巧 呵呵

这哪是什么高级技巧啊？这本来就是很基本的操作啊
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5楼2009-06-24 16:19:23
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
我说的是自动衍生，用gv当然可以，但是要一个一个画。比如：我有一个碎片库，希望把碎片库中的所有碎片生长到某一个结构上，替代其某一个氢原子。
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6楼2009-06-25 22:32:10
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
有没有人知道呢？
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7楼2009-06-27 13:11:44
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shenhai1315

木虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-27 21:42
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-6-24 11:10:
将一个分子碎片固定，然后和若干个碎片连接，新的碎片替代原来碎片上的氢原子，然后生成新的分子

我完全没看明白——难道是我理解有误？我发誓GV完全可以做到这一点

是的
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8楼2009-06-27 21:40:33
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
用GV怎样自动操作，麻烦shenhai1315说的具体一些
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9楼2009-06-29 16:37:51
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
自己顶一下
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10楼2009-07-04 23:39:24
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