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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】【求助】关于分子碎片生长

谁能给推荐一款分子碎片生长的程序,最好是linux下的,而且输入文件最好是pdb或mol2.
就是将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子。先谢谢啦
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★
yuhuobuku(金币+2,VIP+0):谢谢交流 6-24 12:15
将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子

我完全没看明白——难道是我理解有误?我发誓GV完全可以做到这一点
2楼2009-06-24 11:10:04
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Derchief

金虫 (正式写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 12:15
引用回帖:
Originally posted by wuhanhgf2002 at 2009-6-24 11:07:
谁能给推荐一款分子碎片生长的程序,最好是linux下的,而且输入文件最好是pdb或mol2.
就是将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子。先谢谢啦

俺也觉得是。。。gv高级技巧 呵呵
God is a mac.
3楼2009-06-24 11:53:55
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)


yuhuobuku(金币+1,VIP+0):谢谢交流 6-24 18:22
北大来鲁华课题组开发的程序,好像可以。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2009-06-24 12:49:06
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-26 13:19
引用回帖:
Originally posted by Derchief at 2009-6-24 11:53:
俺也觉得是。。。gv高级技巧 呵呵

这哪是什么高级技巧啊?这本来就是很基本的操作啊
5楼2009-06-24 16:19:23
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

我说的是自动衍生,用gv当然可以,但是要一个一个画。比如:我有一个碎片库,希望把碎片库中的所有碎片生长到某一个结构上,替代其某一个氢原子。
6楼2009-06-25 22:32:10
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

有没有人知道呢?
7楼2009-06-27 13:11:44
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shenhai1315

木虫 (正式写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 6-27 21:42
引用回帖:
Originally posted by yjcmwgk at 2009-6-24 11:10:
将一个分子碎片固定,然后和若干个碎片连接,新的碎片替代原来碎片上的氢原子,然后生成新的分子

我完全没看明白——难道是我理解有误?我发誓GV完全可以做到这一点

是的
8楼2009-06-27 21:40:33
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

用GV怎样自动操作,麻烦shenhai1315说的具体一些
9楼2009-06-29 16:37:51
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

自己顶一下
10楼2009-07-04 23:39:24
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