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w.king124

金虫 (正式写手)


[交流] 好奇怪,没有左臂和右臂的质粒能让目的基因在真核细胞中稳定表达吗

本人现在正将目的基因(1KB)与载体大片段(11kb)进行连接,连了四个多月了,一直没有结果,十分的沮丧
由于当初一直找不到合适的载体,就选择了Xho1单酶切(老板告诉以后的连接可能会麻烦点),设计引物时目的基因的两端也是加了该位点,刚开始直接连时,出的菌斑全是假阳性(耗掉了2个月),后来载体做了5‘去磷酸化,也是一直没连上,根本没有出现菌斑,处于崩溃的边缘  马上都研三了!!!!!

上几天偶尔发现一篇文章,是做杜氏盐藻(一种单细胞真核生物,我也是做这个的)表达载体的,他们是在pUC18—T载体的基础上,加入了启动子,目的基因,终止子和一个筛选标记基因,构建完毕后转入盐藻,多代筛选后,提RNA,做RT-PCR,结果在盐藻中稳定表达,现在我也想这么做做试试,虽然风险很大,但是没有其他的退路了
不过我有一点疑问,一个克隆载体加入启动子、终止子会让目的基因表达,但是没有左右臂,转进真核细胞后目的基因会整合到基因组中吗?或者会稳定表达吗?
希望大家献计献策啊

附上该文章
http://www.namipan.com/d/%E6%9D% ... 4f2e092032685ce1400

[ Last edited by w.king124 on 2009-6-16 at 13:37 ]
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ilaveu

木虫 (著名写手)


w.king124(金币+1,VIP+0):谢谢 6-16 14:17
当然可能整合到真核基因组上
随机整合

你1kb连11kb 不应该特别难连
2楼2009-06-16 13:54:27
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w.king124

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by ilaveu at 2009-6-16 13:54:
当然可能整合到真核基因组上
随机整合

你1kb连11kb 不应该特别难连

载体和目的基因的比例必须严格控制在1/3——1/10之间吗,因为就回收20ul,没法定量,所以一般不做定量,还有什么需要注意的地方吗
3楼2009-06-16 14:16:55
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w.king124

金虫 (正式写手)


大家提一下意见吧,有没有什么需要注意的呢,感觉自己做的很认真了,但是可能会忽略某些细节的
4楼2009-06-16 14:21:13
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dyyyyy

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★
w.king124(金币+1,VIP+0):谢谢,我是用takara的T4DNA连接酶,难道说效果不如solution1? 6-16 18:36
w.king124(金币+3,VIP+0):再次感谢,呵呵,我也试一下吧,我还想问一下PMD18和19的solution1都是一样吧,我只有18啊 6-16 20:30
建议还是走常规路线。Xho1是活性较低,建议你把目的片段与载体片段按1:5-1:8混合,加上与混合液等体积的“takara产的t载体pmd19-t中的solution I”,16℃连4小时左右。试试,我连带一个平端的片段,一次就连成了。
5楼2009-06-16 14:50:42
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humants

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
w.king124(金币+4,VIP+0):你这个是双酶切,比较好连,呵呵,我那个还得去磷酸化,再者我的载体比较大,可能也有很大关系,谢谢你的建议了,呵呵 6-17 20:02
我当时做链接的时候用的酶切位点是Nde1和Xho1,我的连接条件是16度过夜连接,然后用自己做的DH5a感受态去做转化,最终长出了一个菌斑,后来PCR,酶切验证就是重组子。
我的体系是:3微升载体片(5.2kb)
                   5微升目的基因(0.9kb)
             1微升buffer
                    约大于1微升ligase。
注:我没有测定DNA的浓度,不过我的酶切片段都很亮,我用的内切酶和ligase是宝生物的。

后来把体系变了一下:
             6微升载体片(5.2kb)
                  3微升目的基因(0.9kb)
             1.2微升buffer
                  1.2微升ligase。
干脆连了24个小时。这次长了很多菌斑。而且基本上都是。

注:做的时候连接时间太长,注意做一下载体自连实验,那样可以知道大体假阳性的比例是多少。
祝你顺利!!!
6楼2009-06-17 08:34:11
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