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xj22667

银虫 (小有名气)

[交流] 求助 Pfu酶PCR

我在用PCR扩增长约280bp的片段时,用Taq酶可以扩增出,但同样的体系和条件用Pfu酶却扩增不出目的片段,请问各位大侠这是什么原因?
由于我要克隆并表达这基因,且Taq酶的出错率较高,所以我一直不敢做下去,我该怎么办啊,救救我啊!

[ Last edited by xj22667 on 2009-6-12 at 13:55 ]
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lynn5180

铜虫 (初入文坛)


sxdxrhyy(金币+1,VIP+0):谢谢参与讨论! 7-27 10:21
280bp就大胆的用rTAQ吧,然后多送几个测序,TAQ的突变率大概在千分之几
大不了用KOD不可能整不出来的
2楼2009-06-12 14:03:25
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
才280bp……无所谓的……只要控制循环数
Pfu的扩增能力是差点,需要降低点退火并且延长聚合时间
3楼2009-06-12 14:07:03
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xj22667

银虫 (小有名气)

上下游引物Tm值都是60度 我设的梯度60度 1min  58度1min 56度1min都扩不出来
应该怎么修改啊
4楼2009-06-12 14:12:03
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xmchen1015

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
试一下53C 30s; 72C 40s ,如果不行再降一下温度
5楼2009-06-12 14:41:52
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xj22667

银虫 (小有名气)

谢谢 我去试试
6楼2009-06-12 15:14:34
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njlf1258

确实仅280bp用一般的Taq就可以了,pfu酶扩增效率要大概低50%。
7楼2009-06-12 15:56:45
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
很多pfu的温度都是68度吧
8楼2009-06-12 15:59:00
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xj22667

银虫 (小有名气)

让我犹豫没往下做是因为用Taq酶我做的阴性对照(用水代替模板)都能扩得出来
所以我觉的结果不可信啊
9楼2009-06-12 16:13:23
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zzm7806


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
用rTaq不放心就用ExTaq试试,我扩1400bp的,用ExTaq,测序没有任何问题!
10楼2009-06-12 17:00:50
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