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webbzc

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助!!qPCR绝对定量,可以用提取的细菌基因组DNA作为标准品么? 已有1人参与

本人生物小白一枚,最近想用实时荧光定量qPCR对几种细菌DNA进行绝对定量。查到的好多方法都是说,得用目的基因转化的质粒去做标准品,绘制标准曲线。但是本人想直接用提取的细菌基因组DNA(或者用普通PCR产物也就是目的基因)进行定量、倍比稀释作为标准品。但是没有查到相关资料,不知道各位大佬的实验室有没有这样做过,望指教!
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zhttt333

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-12-29 22:12:10
用质粒DNA作标准品, 因为长度,DNA非线性等不同于样品,其qpcr efficency 不同于样品而导致结果偏差, 所以用标化的标准菌株中提取基因组dna 作标准品。
6楼2019-12-29 06:37:52
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花随人愿

银虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-12-29 22:11:44
用质粒做标准品,因为质粒浓度是可以精准定量的,这样你的绝对定量才有意义。

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2楼2019-12-04 23:38:27
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webbzc

新虫 (初入文坛)

谢谢,但是最近看到文献中,有直接从标准菌株中提取基因组Dna,定量后倍比稀释作为标准品的。不知道该方法有什么弊端么?

发自小木虫Android客户端
3楼2019-12-08 21:27:32
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webbzc

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 花随人愿 at 2019-12-04 23:38:27
用质粒做标准品,因为质粒浓度是可以精准定量的,这样你的绝对定量才有意义。

谢谢您,但是最近看到文献中,有直接从标准菌株中提取基因组Dna,定量后倍比稀释作为标准品的。不知道该方法有什么弊端么?

发自小木虫Android客户端
4楼2019-12-08 21:27:57
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