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zhangyujin铜虫 (正式写手)
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[交流]
Gromacs能否取出多少距离以内的构型 已有4人参与
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| 请问大家，如果关注的是小分子在蛋白内的光学性质，用GROMACS跑完动力学，如何能取出小分子所在一定范围内，比如5埃之内的构型呢？主要是考虑到这个距离以外的原子对分子性质影响不大。 |
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4楼2020-01-02 17:17:28
cjl123321
铜虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1977.6
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- 帖子: 408
- 在线: 109.3小时
- 虫号: 3822211
- 注册: 2015-04-20
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
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用gmx distance计算小分子与蛋白的距离随时间的变化，通过得到的数据能知道那些时间段小分子和蛋白的距离小于5A，然后去对应的观看这些时间段对应的结构即可 发自小木虫Android客户端 |
2楼2019-12-07 14:58:39
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3楼2019-12-31 16:13:21