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zhangyujin

铜虫 (正式写手)

[交流] Gromacs能否取出多少距离以内的构型 已有4人参与

请问大家,如果关注的是小分子在蛋白内的光学性质,用GROMACS跑完动力学,如何能取出小分子所在一定范围内,比如5埃之内的构型呢?主要是考虑到这个距离以外的原子对分子性质影响不大。
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Hardworking!!
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cjl123321

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
用gmx distance计算小分子与蛋白的距离随时间的变化,通过得到的数据能知道那些时间段小分子和蛋白的距离小于5A,然后去对应的观看这些时间段对应的结构即可

发自小木虫Android客户端
2楼2019-12-07 14:58:39
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pan789

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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3楼2019-12-31 16:13:21
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pl940

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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4楼2020-01-02 17:17:28
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pl995

禁虫 (小有名气)

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5楼2020-01-04 11:12:26
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