应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock里什么情况下把酰胺键设置为可旋转的
51/1返回列表
查看: 1447  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

吃书少年

铜虫 (小有名气)

[交流] autodock里什么情况下把酰胺键设置为可旋转的 已有4人参与

如题，最近做对接，发现把我的小分子里的酰胺键设置为可旋转的话对接效果会比不可旋转好很多。可是酰胺键一般被认为是不可旋转，这样做会不会不合理？但autodock里又有设置酰胺键可旋转的选项，在什么情况下被认为是可旋转的？

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-11-20 23:41:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl979

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
3楼2020-01-07 11:17:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

pl942

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
2楼2020-01-02 09:45:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl967

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
4楼2020-01-09 11:09:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

一代米哟

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
一般是不可旋转，但出现一定程度的旋转也是可以的，毕竟在蛋白口袋内，受到周围残基的影响。将它设置为可旋转，就能得到更多可能性结果，然后再从中挑选出符合预期的就行了。如果不想这么麻烦，推荐用DOCK 6，比AutoDock更准确，详情请百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接（DOCK 6.9）】计算教程。
赞一下 回复此楼
5楼2021-12-02 16:23:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +4 SUICHILD 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:14 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +8 2026调剂侠 2026-03-12 8/400 2026-03-13 13:21 by JourneyLucky
[考研] 求调剂（材料与化工327） +3 爱吃香菜啦 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:28 by houyaoxu
[考研] 求材料调剂 +3 隔壁陈先生 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:20 by 学员8dgXkO
[考研] 315求调剂 +6 小羊小羊_ 2026-03-11 7/350 2026-03-13 08:58 by Linda Hu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 工科278分求调剂 +4 周慢热啊 2026-03-12 6/300 2026-03-12 15:49 by Equinoxhua
[考研] 311求调剂 +7 zchqwer 2026-03-10 7/350 2026-03-12 14:48 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿天津大学材料与化工275求调剂 10+5 穿只靴子 2026-03-07 22/1100 2026-03-11 21:11 by kiokin
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考研] 一志愿浙江大学0856材料与化工求调剂 +3 yansheng@211 2026-03-09 4/200 2026-03-11 10:52 by @飒飒飒飒
[基金申请] 提交后的基金本子，已让学校撤回了，可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +4 无懈可击的巨人 2026-03-10 4/200 2026-03-10 22:45 by 星空星月
[考研] 086000生物与医药319分求调剂 +4 Tolkien 2026-03-07 8/400 2026-03-10 21:34 by Tolkien
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 070300化学求调剂 +5 扑风铃的猫 2026-03-08 10/500 2026-03-09 13:58 by macy2011
[考研] 296求调剂 +4 Xinyu Wu311 2026-03-09 4/200 2026-03-09 11:51 by 勇敢太监王公公
[考研] 求调剂 +3 拾柒12。 2026-03-08 3/150 2026-03-08 17:33 by bingxueer79
[考研] 材料科学（0805）338 求调剂 +7 xiaokang3286 2026-03-07 7/350 2026-03-08 03:42 by lfhuang
[考研] 求调剂，不管什么专业，我是可塑造的人才一枚，希望遇到知己老师捞捞我 +4 13102137290 2026-03-06 5/250 2026-03-07 21:21 by lissomchan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭