| 查看: 2517 | 回复: 17 | |||
[交流]
【求助】怎样做好药物设计及合成已有5人参与
|
|
大家好，本人以后要做药物合成，是关于某一酶抑制剂合成方向的，现在大部分的方法是以某一母体为基础进行衍生物的合成，然后进行活性测试，但这样有时候真的很盲目，好不容易作出衍生物，活性有时候并不一定好，而且论文的原创性也差。现在想请教大家，假设我有该母体的部分衍生物及其活性，包括相应的酶，我是否可以通过计算机模拟处理进行下一步的药物设计或者通过计算说明活性等构效关系，如果行的话，现在我应该先学习哪些软件，谢谢大家！！！不胜感激。 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:16 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
超声仪器发热怎么办
已经有13人回复
-
许下一个心愿
已经有4人回复
-
大龄未婚博士的烦恼
已经有15人回复
-
卷上副教授之后…
已经有24人回复
-
25届博士申请自荐
已经有9人回复
-
本硕双非，研究方向为动态高分子及自修复材料方向。有一篇Angew一作（已接收）
已经有4人回复
-
我们组一个学生一直不明白研究生和本科生的区别
已经有18人回复
-
咨询一下，为什么越小的学校里面的教授说话口气越大？
已经有15人回复
-
手稿被退回给作者了
已经有12人回复
-
现在高校的事业编制中，有员额制和备案制，这是什么？
已经有11人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 做药物合成路线设计时，如何知道它的起始化工原料或医药中间体
已经有4人回复
- 海正药业招聘新药研发人员
已经有45人回复
- 现在微生物哪方面比较热啊
已经有36人回复
- 招聘注册、针剂研发工程师
已经有41人回复
- 【求助】请大家建议北京的高校和研究所中做药物设计合成方向有哪些
已经有3人回复
- 请问成都的睿智化学怎么样啊
已经有7人回复
- 上海桑迪亚医药技术有限责任公司招聘有机合成研究员
已经有19人回复
- 【有奖活动】回忆2010考研专业课题目
已经有54人回复
- 【交流】【有奖参与】来分析版的虫友，请大家介绍一下自己的研究方向^_^
已经有61人回复
syhu_007012
木虫 (正式写手)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 5489.1
- 红花: 3
- 帖子: 346
- 在线: 563.7小时
- 虫号: 68086
- 注册: 2005-05-16
- 专业: 药物化学
2楼2009-06-08 18:51:14
suntao1982
木虫 (著名写手)
小木虫
- 应助: 6 (幼儿园)
- 贵宾: 1.15
- 金币: 3354.9
- 散金: 110
- 红花: 2
- 帖子: 1953
- 在线: 113.3小时
- 虫号: 238181
- 注册: 2006-04-05
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2009-06-08 21:35:50
tjegg
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 26 (小学生)
- 金币: 6869.3
- 红花: 16
- 帖子: 2615
- 在线: 448小时
- 虫号: 338983
- 注册: 2007-04-05
- 性别: GG
- 专业: 抗肿瘤药物药理
4楼2009-06-08 23:16:16
whitewatercn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 199.8
- 红花: 2
- 帖子: 245
- 在线: 10.3小时
- 虫号: 210802
- 注册: 2006-03-07
- 性别: GG
- 专业: 化学信息学、药物设计
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
q68(金币+2,VIP+0):多多交流 6-9 09:57
zhaohscas1976(金币+3,VIP+0):多多交流 6-9 11:11
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
q68(金币+2,VIP+0):多多交流 6-9 09:57
zhaohscas1976(金币+3,VIP+0):多多交流 6-9 11:11
|
（1）PDB中能找到酶的晶体结构的话，可以用分子对接方法试一下 （2）有了一定数量的结构/活性数据的时候，可以做QSAR，2D或3D均可 软件有很多，手头有哪种，或者能买得起哪一种，就用哪一种。用什么软件并不重要，重要的是你得有一个思路 要设计某一酶的抑制剂，你先得对市面上/文献中现有的抑制剂类型作一个全面的调研，它们有什么共性（药效团，物理化学性质），覆盖了那些骨架，你能不能把Scaffold Hopping一下。 你还得对酶的性质了如指掌，有没有酶或复合物的晶体结构，有没有定点突变方面的研究，活性口袋什么形状，有哪些关键残基，有哪些关键作用。。。 什么？你是搞有机合成的，药物化学不懂，也没关系，你一看这个母体结构，就知道哪几个位置是比较容易上取代基的，好，每个位置分别上一个立体位阻大的和小的，电负性大的/小的，组合起来，合成十几二十个化合物，让生物的去测去，测完结果放在一表里，你对着这个表猛看，看了十天八天以后，你就有了一个 hypothesis: 哦，这里要放一个大基团，哪里要放一个亲电的，这就是人肉QSAR。然后你再设计几个化合物，再去测活性，结果回来一看，哦，大基团也不能太大，你修正了你的hypothesis,又重新设计了几个化合物。。。。 |
5楼2009-06-09 09:52:28
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- 模拟EPI: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
6楼2009-06-09 22:33:32
7楼2009-06-10 10:43:51
杞实很简单
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 6284.3
- 散金: 88
- 帖子: 713
- 在线: 102.7小时
- 虫号: 446920
- 注册: 2007-10-30
- 性别: GG
- 专业: 药物分析
8楼2009-06-13 01:43:10
xingchen7_
金虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1909.7
- 散金: 2
- 帖子: 179
- 在线: 93.6小时
- 虫号: 851856
- 注册: 2009-09-19
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
9楼2010-01-13 17:31:14
10楼2010-01-18 21:34:11
24