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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 分子对接时，底物配体与蛋白受体对接时，需不需要加上金属辅因子
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酷儿ccc

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接时，底物配体与蛋白受体对接时，需不需要加上金属辅因子 已有1人参与

最近在做底物与酶的对接，酶的辅因子是亚铁离子，请问在对接时需不需要把辅因子放在里面呀？亚铁的分子式怎么画啊

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1楼 2019-10-25 16:14:49
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一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

一般需要，因为底物不仅与蛋白有作用，还跟辅酶有作用。可以百度搜索【处理PDB结构】小工具教程，将辅酶移动到受体一侧，点击准备按钮就可以获得蛋白-辅酶复合物结构了。后续要做对接，也建议百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接（DOCK 6.9）】计算教程。
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3楼2021-12-02 16:31:43
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L_大松子

新虫 (正式写手)
你好，我第一次用DS这个软件，我想问下你做酶和底物对接时用的是哪种对接方式呀

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2楼2020-02-26 20:10:06
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