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酷儿ccc

新虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接时,底物配体与蛋白受体对接时,需不需要加上金属辅因子 已有1人参与

最近在做底物与酶的对接,酶的辅因子是亚铁离子,请问在对接时需不需要把辅因子放在里面呀?亚铁的分子式怎么画啊

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L_大松子

新虫 (正式写手)

你好,我第一次用DS这个软件,我想问下你做酶和底物对接时用的是哪种对接方式呀

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2楼2020-02-26 20:10:06
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一代米哟

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

一般需要,因为底物不仅与蛋白有作用,还跟辅酶有作用。可以百度搜索【处理PDB结构】小工具教程,将辅酶移动到受体一侧,点击准备按钮就可以获得蛋白-辅酶复合物结构了。后续要做对接,也建议百度搜索【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK 6.9)】计算教程。
3楼2021-12-02 16:31:43
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