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paopaomeng铁杆木虫 (著名写手)
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[交流]
求助桥连水上如何加氢，必谢！
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| 我有个晶体，上面有几个桥连水分子，通过Q峰加上氢后，感觉位置很别扭，那位高手指点一下呀，谢谢了！！ |
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5楼2009-06-07 12:24:57
caty
至尊木虫 (著名写手)
小木虫潜水俱乐部名誉主席
- 应助: 3 (幼儿园)
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- 帖子: 2642
- 在线: 328.2小时
- 虫号: 264460
- 注册: 2006-07-08
- 专业: 金属有机化学
3楼2009-06-07 00:07:55
4楼2009-06-07 11:29:18
alusia
金虫 (正式写手)
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- 注册: 2006-04-01
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- 专业: 配位化学
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paopaomeng(金币+2,VIP+0):谢谢，能具体说说命令什么的吗？ 6-7 13:21
paopaomeng(金币+2,VIP+0):谢谢，能具体说说命令什么的吗？ 6-7 13:21
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理乱加，具体的说，就是根据可能存在的氢键来手工加上H的位置坐标，（不是通过HADD这类指令加），数据可以做到很好，当然，这么做有点 人工 的嫌疑，但是话说回来，常规X衍射对H本来就是不准确的，从Q找也不一定准确，特别是Q值比较大比如Q20, Q30之类的时候更是没什么合理性可言。所以这样做我认为没什么不能接受。相反 ，H在结构中的稳定往往是在H键的作用下实现的，通过H键来确定H的位置基本上还是合理的，虽然由于H键的X....H....X往往存在一定角度的原因，理论找的和事实上会有所偏移实际位置。 [ Last edited by alusia on 2009-6-7 at 13:04 ] |
6楼2009-06-07 13:01:48