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Myprayert

木虫 (正式写手)

[求助] 各位大神知道如何用vmd计算氢键吗?

用vmd导入data文件 输出的氢键是空白:
Parameters used in the calculation of hydrogen bonds:
- Atomselection 1: name 1
- Update selections every frame: yes
- Initial frame: 0
- Frame step: 1
- Final frame: 0
- Donor-Acceptor distance: 3.5
- Angle cutoff: 30
- Type: all
- Write a file with H bond/frame data: yes
- Filename: hbonds.dat
- Details output file: hbonds-details.dat

Printing frame/hbond data to file... Done.
Warning) multiplot: Data vector empty, ignoring plot!


请问大佬们这个问题怎么解决  十分感谢
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pl915

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2020-01-02 11:16:08
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查看全部 9 个回答

cuso4852cuoh

新虫 (小有名气)

楼主,请问您解决了吗?
2楼2019-10-16 08:42:27
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Myprayert

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cuso4852cuoh at 2019-10-16 08:42:27
楼主,请问您解决了吗?

没 愁死了
3楼2019-10-22 16:56:33
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Lzw@

新虫 (初入文坛)

解决了吗?我也遇到求氢键的问题了。

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-11-14 10:29:23
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