24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 2443  |  回复: 8

Myprayert

木虫 (正式写手)

[求助] 各位大神知道如何用vmd计算氢键吗?

用vmd导入data文件 输出的氢键是空白:
Parameters used in the calculation of hydrogen bonds:
- Atomselection 1: name 1
- Update selections every frame: yes
- Initial frame: 0
- Frame step: 1
- Final frame: 0
- Donor-Acceptor distance: 3.5
- Angle cutoff: 30
- Type: all
- Write a file with H bond/frame data: yes
- Filename: hbonds.dat
- Details output file: hbonds-details.dat

Printing frame/hbond data to file... Done.
Warning) multiplot: Data vector empty, ignoring plot!


请问大佬们这个问题怎么解决  十分感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuso4852cuoh

新虫 (小有名气)

楼主,请问您解决了吗?
2楼2019-10-16 08:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cuso4852cuoh at 2019-10-16 08:42:27
楼主,请问您解决了吗?

没 愁死了
3楼2019-10-22 16:56:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lzw@

新虫 (初入文坛)

解决了吗?我也遇到求氢键的问题了。

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-11-14 10:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl915

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2020-01-02 11:16:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl970

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

6楼2020-01-03 14:25:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl852

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

7楼2020-01-04 16:29:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl942

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

8楼2020-01-08 10:46:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl994

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

9楼2020-01-09 14:43:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Myprayert 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +14 李木子啊哈哈 2026-04-12 15/750 2026-04-14 00:14 by Equinoxhua
[考研] 求调剂学校 +3 不会吃肉 2026-04-13 3/150 2026-04-13 23:13 by 木鱼.
[考研] 材料299专硕求调剂 +13 +21 2026-04-09 13/650 2026-04-13 14:16 by 张zhihao
[考研] 求调剂 +9 吃口冰激凌 2026-04-07 9/450 2026-04-13 08:46 by 紫曦紫棋
[硕博家园] 新一代电子信息294求调剂 不挑学校 +7 Ytyt11 2026-04-09 8/400 2026-04-12 16:57 by ajpv风雷
[考研] 295分求调剂 +13 ?要上岸? 2026-04-10 13/650 2026-04-12 15:37 by laoshidan
[考研] 电气专硕320求调剂 +6 小麻子111 2026-04-10 6/300 2026-04-12 10:54 by lemon6009
[考研] 求调剂,一志愿材料科学与工程985,365分, +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 316求调剂 +5 想读研究生( ?∵ 2026-04-07 5/250 2026-04-12 00:43 by 蓝云思雨
[考研] 085500求调剂材料 +10 易11122 2026-04-09 10/500 2026-04-11 10:39 by maddjdld
[考研] 275求调剂 +9 1624447980 2026-04-08 10/500 2026-04-11 10:20 by Delta2012
[考研] 化学工程与技术324调剂 +23 孙常华 2026-04-09 25/1250 2026-04-11 00:07 by 骑牛渡寒江
[考研] 302分求调剂 +9 凡语祈愿 2026-04-08 10/500 2026-04-10 23:26 by 314126402
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +6 白云123456789 2026-04-09 8/400 2026-04-10 21:13 by zhouxiaoyu
[考研] 一志愿京区985,085401电子信息,本科电子信息 +3 阳光开朗的男孩 2026-04-10 3/150 2026-04-10 16:29 by sophia_93
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 332,085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[考研] 材料307分求大佬组收留 +17 Hll胡 2026-04-07 17/850 2026-04-09 10:53 by liuhuiying09
[考研] 263分B区求调剂 +6 李nihao 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:38 by 南开小綦
信息提示
请填处理意见