24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2444  |  回复: 8

Myprayert

木虫 (正式写手)

[求助] 各位大神知道如何用vmd计算氢键吗?

用vmd导入data文件 输出的氢键是空白:
Parameters used in the calculation of hydrogen bonds:
- Atomselection 1: name 1
- Update selections every frame: yes
- Initial frame: 0
- Frame step: 1
- Final frame: 0
- Donor-Acceptor distance: 3.5
- Angle cutoff: 30
- Type: all
- Write a file with H bond/frame data: yes
- Filename: hbonds.dat
- Details output file: hbonds-details.dat

Printing frame/hbond data to file... Done.
Warning) multiplot: Data vector empty, ignoring plot!


请问大佬们这个问题怎么解决  十分感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cuso4852cuoh

新虫 (小有名气)

楼主,请问您解决了吗?
2楼2019-10-16 08:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Myprayert

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cuso4852cuoh at 2019-10-16 08:42:27
楼主,请问您解决了吗?

没 愁死了
3楼2019-10-22 16:56:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lzw@

新虫 (初入文坛)

解决了吗?我也遇到求氢键的问题了。

发自小木虫IOS客户端
4楼2019-11-14 10:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl915

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2020-01-02 11:16:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl970

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

6楼2020-01-03 14:25:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl852

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

7楼2020-01-04 16:29:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl942

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

8楼2020-01-08 10:46:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl994

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

9楼2020-01-09 14:43:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Myprayert 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 急需调剂 +7 绝不放弃22 2026-04-15 8/400 2026-04-17 23:54 by 绝不放弃22
[考研] 260求调剂 +3 Zyt1314520.. 2026-04-17 4/200 2026-04-17 21:06 by Eurekall
[考研] 接受任何调剂 +4 也就是栗子 2026-04-17 4/200 2026-04-17 17:57 by Equinoxhua
[考研] 320求调剂 +4 深郊akm 2026-04-17 4/200 2026-04-17 17:32 by 一切OK
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 5/250 2026-04-17 10:02 by bobvan
[考研] 291求调剂 +9 关忆北. 2026-04-14 9/450 2026-04-16 22:49 by cfdbai
[考研] 294求调剂 +14 淡然654321 2026-04-15 14/700 2026-04-16 21:01 by lpl364211
[考博] 申博自荐 +3 Linxia林夏 2026-04-13 3/150 2026-04-16 12:55 by 墨荷之露
[考研] 327求调剂 +26 Xxjc1107. 2026-04-13 29/1450 2026-04-16 10:52 by Espannnnnol
[考研] 求调剂 +11 小聂爱学习 2026-04-11 15/750 2026-04-15 21:57 by noqvsozv
[考研] 求助调剂,跨调 +19 X十甫寸Y 2026-04-11 20/1000 2026-04-15 21:18 by cuisz
[考研] 0854调剂 +13 长弓傲 2026-04-12 16/800 2026-04-15 13:45 by fenglj492
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +11 不会吃肉 2026-04-12 11/550 2026-04-13 21:59 by bljnqdcc
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 求调剂,一志愿材料科学与工程985,365分, +8 材化李可 2026-04-11 10/500 2026-04-12 08:42 by 852137818
[考研] 一志愿厦大0856,306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
信息提示
请填处理意见