| 查看: 2343 | 回复: 7 | |||
croninszl铁杆木虫 (职业作家)
★★★★★★★★★★★
|
[求助]
如何由晶体的CIF文件生成PDB Summary Validation Report 已有1人参与
|
|
求助：如何由晶体的CIF文件生成PDB Summary Validation Report 投稿某期刊时要求提交晶体的PDB Summary Validation Report (designated with a Confidential watermark) ：When reporting crystal structures, authors must submit the annotated PDB Summary Validation Report (designated with a Confidential watermark) to xxxxxx at the time of submission. 在网上查了好久，查到如下相关的说明信息： https://www.wwpdb.org/validation/validation-reports 如下是可以提交晶体文件并生成PDB Summary Validation Report的网站： https://validate-rcsb-1.wwpdb.org/ 但由于自己对晶体相关的信息不了解，看了好久也基本看不懂。 所以在此希望能寻求大牛的帮忙：如何从一个已经获得的晶体的CIF文件生成一个PDB Summary Validation Report。 如能顺利解决问题，金币数还可以追加。十分感谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
求助几个团簇的cif
已经有0人回复
-
急求该反应的详细机理
已经有5人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有220人回复
-
【Ei | Scopus 双检索】2026年智能交通与未来出行国际会议（CSTFM 2026）
已经有0人回复
-
【EI|Scopus 双检索】2026年第六届机器人与人工智能国际会议（JCRAI 2026）
已经有0人回复
-
zotero的advanced material模板没有更新，有人有新版的cls文件吗
已经有2人回复
-
【高校联合举办】2026年第五届服务机器人国际会议（ICoSR 2026）
已经有0人回复
-
深圳大学化学与环境工程学院超分子团队招收2026级申请-考核制博士生
已经有8人回复
-
中南大学化学化工学院易小艺教授课题组招收2026级博士研究生（第二轮）
已经有0人回复
-
求助
已经有0人回复
 |
2楼2019-10-05 21:44:36
|
|
3楼2019-10-07 13:12:44
|
|
4楼2019-10-08 22:01:01
|
|
5楼2019-10-10 11:16:21
6楼2021-02-03 12:25:30
文言文
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 134 (高中生)
- 金币: 3746.1
- 散金: 294
- 红花: 40
- 帖子: 1429
- 在线: 572.2小时
- 虫号: 652093
- 注册: 2008-11-11
- 专业: 配位化学
【答案】应助回帖
|
以下是从高手们那里综合整理的，用1或者2应该都可以 1.下载一个Discovery Studio软件，这个软件打开cif另存为PDB 2.在ins里加一行wpdb，然后运行shelxl,然后shelxl会生成一个pdb文件，然后你自己去validation 有一个网站叫worldwide protein data bank，可以提供这个validation，网址:wwPDB.org 注: 应该和iucr的checkcif流程类似。 pdb 检查的更全面，更注重结构本身，比如H健，扭转角度等。没有硬性的标准导致的alert。虽然对小分子结构也没什么大用 发自小木虫Android客户端 |
7楼2021-02-03 13:56:36
15735654874
铁虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 48.5
- 红花: 2
- 帖子: 19
- 在线: 25.3小时
- 虫号: 4124604
- 注册: 2015-10-07
- 性别: GG
- 专业: 智能材料
8楼2022-01-07 14:48:23
