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投票标题: 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? (多选)

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  • NAMD + VMD
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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? 已有8人参与

分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
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tiechong

金虫 (著名写手)

Lammps遥遥领先
2楼2019-10-08 11:47:52
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
- Unable to set the chosen unphysical cell parameters”

该如何解决..
3楼2019-11-12 16:38:08
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pl981

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

4楼2020-01-02 14:14:07
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pl910

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

5楼2020-01-03 15:51:18
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pl957

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

6楼2020-01-06 11:40:05
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Z腾飞

新虫 (初入文坛)

7楼2020-08-08 21:51:18
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shabeir

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
从结果看,做材料方面模拟的虫友比较多啊
8楼2022-04-08 17:26:46
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15923438923

新虫 (初入文坛)

9楼2024-12-18 14:03:29
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万物生长1023

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2019-11-12 16:38:08
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
...

重新检查VMD导出坐标时的步骤,留意是否有关于Unit Cell的选项,尝试输入更常规的数值
热爱专业
10楼2025-10-15 15:15:30
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