应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
101/1返回列表

投票标题: 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? (多选)

  • AMBER
    55 (6.5%)
  • ADF
    4 (0.5%)
  • AMBER
    9 (1.1%)
  • CHARMM
    9 (1.1%)
  • Desmond
    6 (0.7%)
  • Discovery Studio
    13 (1.5%)
  • DL_POLY
    3 (0.4%)
  • GROMACS
    162 (19.3%)
  • GROMOS
    22 (2.6%)
  • LAMMPS
    363 (43.2%)
  • Materials Studio
    159 (18.9%)
  • NAMD + VMD
    29 (3.5%)
  • 其它
    6 (0.7%)
查看: 13253  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? 已有8人参与

分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-09-25 15:38:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiechong

金虫 (著名写手)
Lammps遥遥领先
回复此楼
2楼2019-10-08 11:47:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三岁薇恩

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
- Unable to set the chosen unphysical cell parameters”

该如何解决..
赞一下 回复此楼
3楼2019-11-12 16:38:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl981

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
4楼2020-01-02 14:14:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl910

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
5楼2020-01-03 15:51:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl957

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
6楼2020-01-06 11:40:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Z腾飞

新虫 (初入文坛)
LAMMPS
回复此楼
7楼2020-08-08 21:51:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shabeir

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
从结果看，做材料方面模拟的虫友比较多啊
赞一下 回复此楼
8楼2022-04-08 17:26:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

15923438923

新虫 (初入文坛)
lammps
回复此楼
9楼2024-12-18 14:03:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

万物生长1023

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2019-11-12 16:38:08
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
...

重新检查VMD导出坐标时的步骤，留意是否有关于Unit Cell的选项，尝试输入更常规的数值
赞一下 回复此楼
热爱专业
10楼2025-10-15 15:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tiechong 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中科院，化学方向，295求调剂 +3 一氧二氮 2026-03-11 3/150 2026-03-13 12:35 by houyaoxu
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +6 小刘快快上岸 2026-03-11 6/300 2026-03-13 11:11 by houyaoxu
[考研] 085600调剂 +3 漾漾123sun 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:54 by hyswxzs
[考研] 化学学硕求调剂 +7 努力奋斗112 2026-03-12 8/400 2026-03-13 10:51 by houyaoxu
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +3 自由的_飞翔 2026-03-13 4/200 2026-03-13 10:47 by 冠c哥
[考研] 求调剂（材料与化工327） +3 爱吃香菜啦 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:28 by houyaoxu
[考博] 2026博士申请 +7 起泡酒 2026-03-08 7/350 2026-03-13 09:56 by mumu真真
[考研] 315求调剂 +6 小羊小羊_ 2026-03-11 7/350 2026-03-13 08:58 by Linda Hu
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考研] 材料工程调剂 +3 咪咪空空 2026-03-11 3/150 2026-03-12 15:02 by 每天只摆一小会
[考研] 2026考研求调剂-材料类-本科211一志愿985-初试301分 +10 虫友233 2026-03-07 11/550 2026-03-12 14:52 by ruiyingmiao
[考研] 0857 资源与环境 285分 +6 未名考生 2026-03-09 6/300 2026-03-11 21:08 by 30660438
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
[考研] 0817学硕华东区求调剂 +3 30660438 2026-03-08 3/150 2026-03-10 16:55 by Pegasus0429
[考研] 求调剂，数一英一274分 +4 小菲会努力 2026-03-08 4/200 2026-03-09 12:40 by 一定上岸哟_
[考研] 求调剂，一志愿华中科大0702，数一英一，293 +4 小罗露一二 2026-03-07 4/200 2026-03-08 16:36 by 星空星月
[考研] 求调剂，不管什么专业，我是可塑造的人才一枚，希望遇到知己老师捞捞我 +4 13102137290 2026-03-06 5/250 2026-03-07 21:21 by lissomchan
[考研] 一志愿中国石油大学（华东） 本科齐鲁工业大学 求调剂 +3 snw石 2026-03-07 3/150 2026-03-07 20:01 by houyaoxu
[考研] 085600材料与化工 292分 求调剂 +6 程晴之 2026-03-06 6/300 2026-03-07 09:22 by 斩魂滴兔子！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭