应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
101/1返回列表

投票标题: 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? (多选)

  • AMBER
    55 (6.5%)
  • ADF
    4 (0.5%)
  • AMBER
    9 (1.1%)
  • CHARMM
    9 (1.1%)
  • Desmond
    6 (0.7%)
  • Discovery Studio
    13 (1.5%)
  • DL_POLY
    3 (0.4%)
  • GROMACS
    162 (19.3%)
  • GROMOS
    22 (2.6%)
  • LAMMPS
    363 (43.2%)
  • Materials Studio
    159 (18.9%)
  • NAMD + VMD
    29 (3.5%)
  • 其它
    6 (0.7%)
查看: 13258  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? 已有8人参与

分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-09-25 15:38:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tiechong

金虫 (著名写手)
Lammps遥遥领先
回复此楼
2楼2019-10-08 11:47:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三岁薇恩

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
- Unable to set the chosen unphysical cell parameters”

该如何解决..
赞一下 回复此楼
3楼2019-11-12 16:38:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl981

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
4楼2020-01-02 14:14:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl910

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
5楼2020-01-03 15:51:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl957

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
6楼2020-01-06 11:40:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Z腾飞

新虫 (初入文坛)
LAMMPS
回复此楼
7楼2020-08-08 21:51:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shabeir

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
从结果看，做材料方面模拟的虫友比较多啊
赞一下 回复此楼
8楼2022-04-08 17:26:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

15923438923

新虫 (初入文坛)
lammps
回复此楼
9楼2024-12-18 14:03:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

万物生长1023

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2019-11-12 16:38:08
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
...

重新检查VMD导出坐标时的步骤，留意是否有关于Unit Cell的选项，尝试输入更常规的数值
赞一下 回复此楼
热爱专业
10楼2025-10-15 15:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tiechong 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 化学学硕求调剂 +8 努力奋斗112 2026-03-12 9/450 2026-03-13 15:41 by JourneyLucky
[考研] 283求调剂 +4 小楼。 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:30 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。，。，。，。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 材料调剂，307分 +13 张泳铭1 2026-03-09 17/850 2026-03-13 11:09 by 薛云鹏
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 0703化学调剂 +8 小奶苍 2026-03-07 8/400 2026-03-12 22:05 by 飞仙戟羽
[考研] 材料371求调剂 +8 鳄鱼? 2026-03-11 10/500 2026-03-12 14:50 by ruiyingmiao
[考研] 081200计算机科学与技术数一英一306求调剂 +3 intankt 2026-03-08 3/150 2026-03-11 10:50 by dandan413
[基金申请] PDF在线压缩软件 10+3 haxia 2026-03-08 4/200 2026-03-10 13:44 by lfy8008
[考研] 家人们 调剂不迷路 看这里 +8 likeihood 2026-03-09 13/650 2026-03-10 08:09 by likeihood
[考研] 334求调剂 +5 Trying] 2026-03-07 5/250 2026-03-09 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 070300化学求调剂 +5 扑风铃的猫 2026-03-08 10/500 2026-03-09 13:58 by macy2011
[考研] 301求调剂 +5 一二LV 2026-03-07 5/250 2026-03-07 22:20 by 18137688336
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭