应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
51/1返回列表

投票标题: 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? (多选)

  • AMBER
    55 (6.5%)
  • ADF
    4 (0.5%)
  • AMBER
    9 (1.1%)
  • CHARMM
    9 (1.1%)
  • Desmond
    6 (0.7%)
  • Discovery Studio
    13 (1.5%)
  • DL_POLY
    3 (0.4%)
  • GROMACS
    162 (19.3%)
  • GROMOS
    22 (2.6%)
  • LAMMPS
    363 (43.2%)
  • Materials Studio
    159 (18.9%)
  • NAMD + VMD
    29 (3.5%)
  • 其它
    6 (0.7%)
查看: 13282  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] 分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian? 已有8人参与

分子动力学模拟最普及的软件, 谁是MD里的Gaussian?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-09-25 15:38:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl957

禁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
6楼2020-01-06 11:40:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

三岁薇恩

新虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
- Unable to set the chosen unphysical cell parameters”

该如何解决..
赞一下 回复此楼
3楼2019-11-12 16:38:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shabeir

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
从结果看，做材料方面模拟的虫友比较多啊
赞一下 回复此楼
8楼2022-04-08 17:26:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

万物生长1023

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2019-11-12 16:38:08
借个楼 请问MS读入VMD输出的pdb文件 出现如下提示

“The document could not be imported:
Failed to import document from E:\3-Thermal conductivity calculation of GNR\10nm-4.2nm-AGNR\10-4.2-AGNR.pdb.
...

重新检查VMD导出坐标时的步骤，留意是否有关于Unit Cell的选项，尝试输入更常规的数值
赞一下 回复此楼
热爱专业
10楼2025-10-15 15:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +5 不知道叫什么！ 2026-03-15 6/300 2026-03-15 10:16 by Rwx321
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-15 3/150 2026-03-15 09:12 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +4 @将就将就看 2026-03-10 8/400 2026-03-14 14:23 by 千千运气
[考研] 考研求调剂，工科，总分304 +5 矮子不想长高了 2026-03-08 8/400 2026-03-14 04:04 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +3 归零lbm 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:20 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 一志愿山大 321分 求调剂 +7 每天散步 2026-03-09 8/400 2026-03-14 02:18 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-09 3/150 2026-03-14 01:57 by JourneyLucky
[考研] 环境调剂 +6 晓看天暮看云 2026-03-09 6/300 2026-03-14 01:16 by JourneyLucky
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 Zz版 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:36 by 18595523086
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 材料调剂，307分 +13 张泳铭1 2026-03-09 17/850 2026-03-13 11:09 by 薛云鹏
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿江南大学085701环境工程专硕总分287求调剂 +5 18266118446 2026-03-09 5/250 2026-03-11 16:51 by 2020015
[考研] 0857环境调剂 +5 熠熠_11 2026-03-10 5/250 2026-03-11 10:59 by wang_dand
[基金申请] 提交后的基金本子，已让学校撤回了，可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭