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gwdavid木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
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【求助】最陡下降优化错误
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在用gromacs进行最陡下降法优化时,出现如下错误,该如何调整修正? Any information or suggesteion would be greatly appreaciated! Step 13, time 0.026 (ps) LINCS WARNING relative constraint deviation after LINCS: rms 0.004192, max 0.104158 (between atoms 7916 and 7915) bonds that rotated more than 30 degrees: atom 1 atom 2 angle previous, current, constraint length 7935 7933 31.8 0.1413 0.1458 0.1390 7934 7933 32.3 0.1416 0.1463 0.1390 7940 7934 32.6 0.1422 0.1475 0.1390 7922 7915 37.1 0.1473 0.1527 0.1390 7916 7915 38.6 0.1478 0.1535 0.1390 7936 7935 30.3 0.1410 0.1448 0.1390 7937 7936 31.9 0.1419 0.1466 0.1390 7940 7937 33.7 0.1428 0.1488 0.1390 7917 7916 37.4 0.1468 0.1528 0.1390 7920 7917 34.3 0.1443 0.1490 0.1390 7921 7920 32.6 0.1430 0.1465 0.1390 7922 7921 34.2 0.1448 0.1491 0.1390 [ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:54 ] |
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