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jiajiawuwsw

银虫 (小有名气)

[交流] 提到的DNA总降解是怎么回事

我做的是醋酸菌,G-,最近提到的DNA降解特别严重,电泳结果有时候全部是弥散,看不到主带。
我用的方法如下:
收集菌体,加Saline-EDTA buffer(pH8.0),
1. Lysozyme+RNase, 37度,30min;
2.ProteinaseK, 37度,1h;
3.10uL25% SDS, 水浴65度,10min;
4.CTAB, 醋酸钠buffer;
5.氯仿:异戊醇(24:1)抽提两次;
6.冷乙醇沉淀;
7.70%乙醇洗涤一次;
8.干燥,nucleic acid -free water 溶解。

通常在冷乙醇沉淀离心后可以看到明显的白色沉淀,Nano-drop结果也很高,但是电泳结果却是弥散的带。过去,我一直在用这个方法,但最近总是拿不到DNA,酶和试剂也都换了一遍,结果还是不行。

可能我有些重要的细节没有注意好,请各位不吝赐教!
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weizhenlin

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我觉得应该不是操作时动作的问题,蛋白酶K使用时37度是否不太好,这个温度也是DNAase的活性区间,可以尝试提高到60度左右试一下。氯仿抽提时注意颠倒混匀,放在水平摇床上慢摇10分钟,充分变性各种蛋白质。
祝好运!
7楼2009-06-04 16:27:44
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
换试剂盒试试?gDNA不应该是略弥散的带吗?
金币是赌出来的
2楼2009-06-04 10:22:52
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jin56419303

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
你说的还是不够详细,具体问题具体分析嘛,方法大致不会有问题,你操作时尽量细致点,不要太剧烈,有一点弥散也是很正常的
3楼2009-06-04 15:00:52
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大海一孤舟

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
菌体DNA是有一点分散的,在提取过程中注意动作的强度
4楼2009-06-04 15:01:21
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