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【求助】GV 构建模型求助
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在GV 中， 我已经构建了一个体系的一部分， 现在需要把坐标系的原点固定到另一个原子上，也就是平移一下坐标系， 然后再使用晶体工具长余下的部分？ 现在的问题是， 如何平移坐标系呢？ [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 18:49 ] |
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见http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1304676第10楼： 完全可以用GaussView实现，可以完美地将任何原子放到任意坐标上，且分子整体平移。 不过需要一些绝密技巧，一般人我不告诉他： 比如，你想把某个原子（比如7号原子）移到坐标为（3.0,4.0,5.0）的位置上，同时分子跟着一起动，则可以： 1. 将7号原子平移到坐标原点： 在GaussView中打开PBC面板，在Symmetry选项卡里，Lattice Dimesions下拉菜单选择Three（三维）。然后切换到Cell选项卡，点击Place按钮，在Moving下拉菜单中选择Whole Cell。然后用鼠标点击窗体中的7号原子。再回到PBC面板的Symmetry选项卡，将Lattice Dimesions下拉菜单选择为None。这是你可以看到7号原子已经被放到坐标原点上了。 2. 添加虚原子： 打开Atom List...面板。到最后一行（即“Add”那一行），添加虚原子X。然后更改最后三列即X, Y, Z坐标为(-3.0, -4.0, -5.0)。点击Add按钮添加该X原子。 3. 将X原子平移到坐标原点： 方法同步骤1。 4. 删掉X原子。这是7号原子的坐标就是（3.0,4.0,5.0），且分子整体平移。 |
2楼2009-06-04 00:14:10
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7楼2009-06-05 18:27:44
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