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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

[交流] 【求助】GV 构建模型求助

在GV 中, 我已经构建了一个体系的一部分, 现在需要把坐标系的原点固定到另一个原子上,也就是平移一下坐标系,

然后再使用晶体工具长余下的部分?

现在的问题是, 如何平移坐标系呢?

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 18:49 ]
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
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neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 6-4 10:56
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1304676第10楼:

完全可以用GaussView实现,可以完美地将任何原子放到任意坐标上,且分子整体平移。

不过需要一些绝密技巧,一般人我不告诉他:

比如,你想把某个原子(比如7号原子)移到坐标为(3.0,4.0,5.0)的位置上,同时分子跟着一起动,则可以:

1. 将7号原子平移到坐标原点:

在GaussView中打开PBC面板,在Symmetry选项卡里,Lattice Dimesions下拉菜单选择Three(三维)。然后切换到Cell选项卡,点击Place按钮,在Moving下拉菜单中选择Whole Cell。然后用鼠标点击窗体中的7号原子。再回到PBC面板的Symmetry选项卡,将Lattice Dimesions下拉菜单选择为None。这是你可以看到7号原子已经被放到坐标原点上了。

2. 添加虚原子:

打开Atom List...面板。到最后一行(即“Add”那一行),添加虚原子X。然后更改最后三列即X, Y, Z坐标为(-3.0, -4.0, -5.0)。点击Add按钮添加该X原子。

3. 将X原子平移到坐标原点:

方法同步骤1。

4. 删掉X原子。这是7号原子的坐标就是(3.0,4.0,5.0),且分子整体平移。
Simpler, stronger, more tolerant
2楼2009-06-04 00:14:10
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iamddba

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼上说的很详细很专业啊,啥时用这功能了好好研究研究
3楼2009-06-04 08:53:03
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

谢谢neweroica

太感谢了

我自己作一下。。。。。
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2009-06-04 08:56:26
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水月慧心

金虫 (正式写手)

学习了 呵呵
5楼2009-06-04 14:30:31
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

太强了,我也学习下
6楼2009-06-05 13:17:16
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):也谢谢你 6-5 19:57
我的使用经验......

在win版本的 gv 3.07 上, 以上的教程不起作用......
在linux版本的gv 4.12上么, 上面的说法,完全可以实现....

再一次感谢neweroica的指点
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
7楼2009-06-05 18:27:44
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