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chunfengxiyu

新虫 (正式写手)


[交流] 动植物无参考基因组遗传谱图的构建

请教一下做GWAS,遗传进化的同学们,如果做了一批植物的上百个样本的全基因组测序,但是这个植物的参考基因组只组装到了scaffold水平,想构建遗传图谱的话,怎样进行操作呢。首先需要组装,然后call SNP,然后得到的vcf文件有很多scaffold,怎样进行cluster 得到主要的连锁图谱呢?
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syhorchid2楼
2019-09-15 00:55   回复  
chunfengxiyu(金币+1): 谢谢参与
2019-09-15 09:19   回复  
chunfengxiyu(金币+1): 谢谢参与
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xqyqwy4楼
2019-09-15 10:03   回复  
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nono20095楼
2019-09-15 14:40   回复  
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2019-09-16 08:58   回复  
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